41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0279 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  100 
 
 		 472 aa  949    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  79.24 
 
 		 472 aa  763    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  80.08 
 
 		 472 aa  767    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  65.16 
 
 		 446 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  39.19 
 
 		 490 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  37.82 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  36.97 
 
 		 483 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  34.53 
 
 		 502 aa  327  3e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  34.83 
 
 		 535 aa  326  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  34.88 
 
 		 491 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  27.08 
 
 		 480 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  28.91 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  28.91 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  25.6 
 
 		 494 aa  166  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  27.13 
 
 		 487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  25.41 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  26.38 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  24.9 
 
 		 486 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  29.96 
 
 		 396 aa  106  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  29.08 
 
 		 394 aa  104  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  29.08 
 
 		 394 aa  104  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  28.57 
 
 		 390 aa  91.3  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1118 aa  83.6  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1093  RecB family-like nuclease  27.11 
 
 		 366 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  20.5 
 
 		 1082 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  20.35 
 
 		 1126 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0167  RecB family-like nuclease  20.74 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  21.71 
 
 		 1116 aa  67.8  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  21.84 
 
 		 495 aa  62.4  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  21.39 
 
 		 1143 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  20.95 
 
 		 1153 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  21.39 
 
 		 1143 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  21.39 
 
 		 1143 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  21.34 
 
 		 1151 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  20.2 
 
 		 1121 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  18.3 
 
 		 1280 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  20.69 
 
 		 1198 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  19.48 
 
 		 1250 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  21.38 
 
 		 1163 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  21.4 
 
 		 1139 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0119  RecB family nuclease, putative  18.54 
 
 		 479 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>