39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0818 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  100 
 
 
394 aa  803    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  100 
 
 
394 aa  803    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  31.92 
 
 
390 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  27.61 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  24.81 
 
 
512 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  27.25 
 
 
480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  25 
 
 
494 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1093  RecB family-like nuclease  31.8 
 
 
366 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  29.08 
 
 
472 aa  106  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  26.16 
 
 
493 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  26.08 
 
 
487 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  26.16 
 
 
493 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  28.94 
 
 
472 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  24.94 
 
 
490 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  24.94 
 
 
486 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  25.12 
 
 
512 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  27.27 
 
 
446 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  26.84 
 
 
483 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  28.72 
 
 
472 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  27.16 
 
 
483 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  27.49 
 
 
491 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  28.38 
 
 
535 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  26.67 
 
 
502 aa  79.7  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  25.79 
 
 
1118 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  26.83 
 
 
1082 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  24.08 
 
 
495 aa  69.3  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  26.12 
 
 
1121 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0012  hypothetical protein  25.12 
 
 
493 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140441  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25.18 
 
 
1126 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0149  RecB family nuclease, putative  22.59 
 
 
576 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1827  hypothetical protein  21.51 
 
 
488 aa  50.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.698781  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  22.92 
 
 
1163 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  23.97 
 
 
1151 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0421  hypothetical protein  23.24 
 
 
493 aa  47.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.805168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0046  nuclease (RecB family)-like protein  22.49 
 
 
544 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  21.45 
 
 
1116 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  28.09 
 
 
388 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0274  DNA-directed DNA polymerase  29.33 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2037  DNA polymerase IV  35.85 
 
 
354 aa  43.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>