57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3349 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  100 
 
 
512 aa  1050    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  50.79 
 
 
512 aa  526  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  54.75 
 
 
494 aa  524  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  53.77 
 
 
486 aa  508  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  49.79 
 
 
487 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  47.47 
 
 
493 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  47.47 
 
 
493 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  46.37 
 
 
480 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  29.8 
 
 
502 aa  187  5e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  30.69 
 
 
535 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  26.07 
 
 
483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  26.83 
 
 
472 aa  173  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  26.71 
 
 
472 aa  173  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  25.25 
 
 
483 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  30.44 
 
 
491 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  25.6 
 
 
490 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  25.41 
 
 
472 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  27.72 
 
 
446 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  30.38 
 
 
1118 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  27.61 
 
 
1082 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25.7 
 
 
1126 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.4 
 
 
1116 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  27.95 
 
 
396 aa  123  8e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  25.86 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  25.06 
 
 
394 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  25.06 
 
 
394 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  25.56 
 
 
390 aa  106  9e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0167  RecB family-like nuclease  25.7 
 
 
526 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  26.26 
 
 
1172 aa  100  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3875  RecB family-like nuclease  23.83 
 
 
499 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00135732  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  27.47 
 
 
1280 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  23.85 
 
 
1153 aa  90.9  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  25.62 
 
 
1198 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  25.06 
 
 
1151 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1093  RecB family-like nuclease  24.92 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  26 
 
 
1139 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  24.75 
 
 
1196 aa  83.2  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  24.39 
 
 
1163 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  23.06 
 
 
1215 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  23.69 
 
 
1250 aa  80.9  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  25 
 
 
1228 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  23.78 
 
 
1247 aa  75.1  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  23.76 
 
 
1121 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  23.86 
 
 
1215 aa  73.6  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  25.68 
 
 
1143 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  25.68 
 
 
1143 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  25.68 
 
 
1143 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0149  RecB family nuclease, putative  23.9 
 
 
576 aa  71.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  23.54 
 
 
1270 aa  66.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  20.88 
 
 
522 aa  62  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.33 
 
 
1324 aa  60.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  21.85 
 
 
1350 aa  60.5  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0046  nuclease (RecB family)-like protein  25.08 
 
 
544 aa  57.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00680  predicted nuclease (RecB family)  22.4 
 
 
545 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  25.75 
 
 
1255 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  24.26 
 
 
1175 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0119  RecB family nuclease, putative  31.76 
 
 
479 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>