56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0186 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1058    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  50.79 
 
 		 512 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  52.05 
 
 		 494 aa  522  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  49.42 
 
 		 486 aa  496  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  45.47 
 
 		 493 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  45.47 
 
 		 493 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  42.75 
 
 		 487 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  40.12 
 
 		 480 aa  388  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  28.35 
 
 		 535 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  27.88 
 
 		 502 aa  200  7e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  26.83 
 
 		 490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  27.32 
 
 		 491 aa  179  8e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  26.91 
 
 		 483 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  26.2 
 
 		 483 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  26.38 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  26.82 
 
 		 472 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  25.93 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  28.11 
 
 		 446 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1118 aa  145  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  27.32 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  33.22 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1126 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  25.34 
 
 		 1082 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1116 aa  106  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  28.01 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1172 aa  95.1  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  25.12 
 
 		 394 aa  93.6  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  25.12 
 
 		 394 aa  93.6  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  22.94 
 
 		 1198 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  22.06 
 
 		 1280 aa  86.7  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  22.75 
 
 		 1153 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3875  RecB family-like nuclease  21.93 
 
 		 499 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00135732  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1093  RecB family-like nuclease  25.86 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  19.95 
 
 		 1121 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  25.81 
 
 		 1151 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  21.43 
 
 		 1228 aa  71.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  24.38 
 
 		 1250 aa  70.1  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  20.84 
 
 		 1247 aa  69.7  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  26.54 
 
 		 1163 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  22.29 
 
 		 1270 aa  63.9  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0167  RecB family-like nuclease  22.43 
 
 		 526 aa  60.1  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  21.53 
 
 		 1196 aa  60.1  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0046  nuclease (RecB family)-like protein  21.5 
 
 		 544 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00680  predicted nuclease (RecB family)  22.08 
 
 		 545 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.66 
 
 		 1324 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  20.72 
 
 		 1143 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0149  RecB family nuclease, putative  31.87 
 
 		 576 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  20.72 
 
 		 1143 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  20.72 
 
 		 1143 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  21.76 
 
 		 522 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1215 aa  50.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  20.9 
 
 		 1139 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  20.11 
 
 		 1350 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  27.46 
 
 		 1255 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0119  RecB family nuclease, putative  23.25 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  20.63 
 
 		 1175 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>