20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3875 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3875  RecB family-like nuclease  100 
 
 		 499 aa  999    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00135732  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0167  RecB family-like nuclease  67.27 
 
 		 526 aa  611  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  24.15 
 
 		 487 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  23.83 
 
 		 512 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  21.93 
 
 		 483 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  21.93 
 
 		 483 aa  96.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  24.85 
 
 		 480 aa  96.3  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  21.69 
 
 		 493 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  21.69 
 
 		 493 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  21.93 
 
 		 512 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  23.44 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  20.69 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  22.02 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  25.64 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  25.89 
 
 		 535 aa  70.5  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  20.57 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  20.54 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  24.84 
 
 		 502 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  20.24 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1118 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>