53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_24981 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  68.16 
 
 		 502 aa  652    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  69.75 
 
 		 491 aa  643    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  100 
 
 		 535 aa  1056    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  44.65 
 
 		 490 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  43.13 
 
 		 483 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  42.92 
 
 		 483 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  34.96 
 
 		 472 aa  340  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  34.66 
 
 		 472 aa  335  9e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  34.11 
 
 		 472 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  33.85 
 
 		 446 aa  313  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  28.35 
 
 		 512 aa  212  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  30.39 
 
 		 493 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  30.39 
 
 		 493 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  30.92 
 
 		 487 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  30.43 
 
 		 512 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  28.46 
 
 		 486 aa  186  7e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  28.34 
 
 		 494 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  32.99 
 
 		 480 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1126 aa  104  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1118 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  24.83 
 
 		 396 aa  87.4  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1093  RecB family-like nuclease  22.94 
 
 		 366 aa  87.4  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1116 aa  87  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  26.82 
 
 		 1280 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  26.81 
 
 		 390 aa  83.2  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  27.21 
 
 		 1082 aa  81.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  28.28 
 
 		 394 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  28.28 
 
 		 394 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  25.25 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  21.98 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3875  RecB family-like nuclease  25.68 
 
 		 499 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00135732  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  27.55 
 
 		 1270 aa  72.4  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  25.23 
 
 		 1153 aa  70.5  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  27.41 
 
 		 1163 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  27.53 
 
 		 1143 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1139 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  27.53 
 
 		 1143 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  27.53 
 
 		 1143 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0167  RecB family-like nuclease  25.97 
 
 		 526 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1121 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1350 aa  61.6  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  26.15 
 
 		 1250 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1215 aa  58.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1215 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  26.02 
 
 		 1151 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  24.31 
 
 		 1228 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  24.13 
 
 		 1198 aa  53.5  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1247 aa  50.1  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  30 
 
 		 1172 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4890  spermidine synthase  62 
 
 		 405 aa  47.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  25.57 
 
 		 1196 aa  45.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0149  RecB family nuclease, putative  30.58 
 
 		 576 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.36 
 
 		 1324 aa  43.9  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>