23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0167 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3875  RecB family-like nuclease  67.27 
 
 		 499 aa  649    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00135732  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0167  RecB family-like nuclease  100 
 
 		 526 aa  1034    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  26.25 
 
 		 512 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  27.97 
 
 		 480 aa  97.8  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  24.45 
 
 		 487 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  25.33 
 
 		 486 aa  87.8  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  24.42 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  24.3 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  23.91 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  23.91 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  21.46 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  19.69 
 
 		 472 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  21.88 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  21.46 
 
 		 512 aa  67.4  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1118 aa  66.6  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  20.18 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  26.51 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  21.36 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  19.26 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  25 
 
 		 535 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  19.14 
 
 		 390 aa  55.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  27.12 
 
 		 491 aa  54.3  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  26.24 
 
 		 1082 aa  50.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>