49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_03101 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  100 
 
 		 446 aa  909    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  65.16 
 
 		 472 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  64.79 
 
 		 472 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  65.08 
 
 		 472 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  38.72 
 
 		 483 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  37.83 
 
 		 483 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  39.42 
 
 		 490 aa  320  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  33.71 
 
 		 535 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  34.74 
 
 		 491 aa  293  3e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  33.7 
 
 		 502 aa  290  3e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  31.09 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  31.09 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  28.17 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  29.09 
 
 		 487 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  27.72 
 
 		 512 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  28.28 
 
 		 494 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  28.11 
 
 		 512 aa  149  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  26.18 
 
 		 486 aa  147  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  30.8 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  27.27 
 
 		 394 aa  96.7  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  27.27 
 
 		 394 aa  96.7  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  30.37 
 
 		 390 aa  90.5  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1118 aa  86.7  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1093  RecB family-like nuclease  31.74 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  24.77 
 
 		 1143 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  24.77 
 
 		 1143 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  24.77 
 
 		 1143 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  20.73 
 
 		 1116 aa  71.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  22 
 
 		 1082 aa  70.1  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  22.05 
 
 		 1280 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1121 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  23.82 
 
 		 1151 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1126 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  21.73 
 
 		 1198 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0167  RecB family-like nuclease  21.36 
 
 		 526 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  23.28 
 
 		 1163 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  22.65 
 
 		 1153 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3875  RecB family-like nuclease  20.24 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00135732  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  24.44 
 
 		 495 aa  56.6  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25 
 
 		 1324 aa  53.1  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  22.35 
 
 		 522 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  18.39 
 
 		 1196 aa  50.4  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1139 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1215 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  20.94 
 
 		 1250 aa  46.6  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1350 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0046  nuclease (RecB family)-like protein  21.27 
 
 		 544 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  20.62 
 
 		 1270 aa  43.1  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1215 aa  43.5  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>