45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_03571 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  94.82 
 
 		 483 aa  940    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  100 
 
 		 483 aa  977    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  42.95 
 
 		 491 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  42.89 
 
 		 535 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  43.13 
 
 		 502 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  42.26 
 
 		 490 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  39.2 
 
 		 472 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  37.82 
 
 		 472 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  38.72 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  38.16 
 
 		 472 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  28.11 
 
 		 486 aa  182  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  24.79 
 
 		 480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  26.07 
 
 		 512 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  26.91 
 
 		 512 aa  173  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  25.75 
 
 		 487 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  26.39 
 
 		 494 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  24.81 
 
 		 493 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  24.81 
 
 		 493 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3875  RecB family-like nuclease  21.93 
 
 		 499 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00135732  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  26.84 
 
 		 394 aa  94  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  26.84 
 
 		 394 aa  94  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  27.56 
 
 		 396 aa  87  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1118 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0167  RecB family-like nuclease  23.86 
 
 		 526 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  24.29 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  22.28 
 
 		 1126 aa  69.7  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1093  RecB family-like nuclease  27.62 
 
 		 366 aa  69.7  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  21.16 
 
 		 1082 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  22.51 
 
 		 1280 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1116 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  20.11 
 
 		 1153 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  22.74 
 
 		 1143 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  22.74 
 
 		 1143 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  22.74 
 
 		 1143 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  19.95 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  20.79 
 
 		 1163 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1121 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  21.5 
 
 		 1151 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  18.27 
 
 		 1228 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  21.29 
 
 		 1198 aa  47  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.53 
 
 		 198 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  19.56 
 
 		 1250 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  20 
 
 		 1196 aa  44.3  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  21.19 
 
 		 1172 aa  43.9  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  21.55 
 
 		 522 aa  43.1  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>