51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0258 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  996    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  76.54 
 
 		 491 aa  714    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  67.98 
 
 		 535 aa  634    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  44.44 
 
 		 490 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  43.97 
 
 		 483 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  43.13 
 
 		 483 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  35.98 
 
 		 472 aa  336  7e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  34.53 
 
 		 472 aa  335  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  34.94 
 
 		 472 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  33.7 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  30.36 
 
 		 487 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  27.88 
 
 		 512 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  32.92 
 
 		 480 aa  194  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  29.8 
 
 		 512 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  28.06 
 
 		 494 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  28.06 
 
 		 486 aa  181  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  26.9 
 
 		 396 aa  101  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1118 aa  97.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1093  RecB family-like nuclease  23.67 
 
 		 366 aa  95.9  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  27.17 
 
 		 390 aa  90.5  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  20.99 
 
 		 495 aa  80.9  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1126 aa  80.5  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  26.67 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  26.67 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  26.94 
 
 		 1082 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  26.84 
 
 		 1270 aa  70.5  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1116 aa  69.7  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1121 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  26.2 
 
 		 1280 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  25.06 
 
 		 1153 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0167  RecB family-like nuclease  26.51 
 
 		 526 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3875  RecB family-like nuclease  24.49 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00135732  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1247 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  25.23 
 
 		 1198 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  25.31 
 
 		 1228 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  24.93 
 
 		 1250 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1139 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  22.08 
 
 		 522 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1172 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  26.3 
 
 		 1143 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  26.3 
 
 		 1143 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  26.3 
 
 		 1143 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  24.68 
 
 		 1151 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  21.67 
 
 		 1215 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  37.7 
 
 		 864 aa  48.5  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1350 aa  48.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  28.79 
 
 		 1163 aa  47  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  21.88 
 
 		 1196 aa  44.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  31.03 
 
 		 827 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>