34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1093 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1093  RecB family-like nuclease  100 
 
 		 366 aa  737    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  38.19 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  30.21 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  31.8 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  31.8 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  23.67 
 
 		 502 aa  95.9  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  25.1 
 
 		 480 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  25.86 
 
 		 487 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  22.94 
 
 		 535 aa  89.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  26.49 
 
 		 494 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  24.92 
 
 		 512 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  26.04 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  25.86 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  27.11 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  23.97 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  23.97 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  25.7 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  21.51 
 
 		 491 aa  76.3  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  31.74 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  25 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  25.24 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  25.6 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  22.97 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  27.62 
 
 		 483 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1116 aa  67.4  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1118 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1126 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  20.07 
 
 		 1082 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  21.13 
 
 		 1121 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  30.71 
 
 		 1143 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  30.71 
 
 		 1143 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  30.71 
 
 		 1143 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0149  RecB family nuclease, putative  29.76 
 
 		 576 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  24.38 
 
 		 1153 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>