171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1529 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  100 
 
 		 1175 aa  2306    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  50.33 
 
 		 1198 aa  971    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  46.82 
 
 		 1153 aa  890    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  50.65 
 
 		 1280 aa  537  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  36.44 
 
 		 1250 aa  502  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  37.41 
 
 		 1228 aa  479  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  37.4 
 
 		 1163 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  34.25 
 
 		 1215 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  38.14 
 
 		 1139 aa  476  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  35.49 
 
 		 1151 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  39.14 
 
 		 1324 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  35.74 
 
 		 1215 aa  463  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  37.58 
 
 		 1143 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  37.58 
 
 		 1143 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  37.41 
 
 		 1143 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1116 aa  449  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  31 
 
 		 1118 aa  445  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1126 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1247 aa  417  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  33.87 
 
 		 1196 aa  402  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1172 aa  398  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  33.36 
 
 		 1082 aa  379  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  34.56 
 
 		 1121 aa  365  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  46.93 
 
 		 1270 aa  333  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  39.3 
 
 		 1350 aa  301  6e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  28.99 
 
 		 522 aa  117  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  27.53 
 
 		 606 aa  108  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  30.15 
 
 		 986 aa  107  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  30.89 
 
 		 902 aa  105  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  27.66 
 
 		 1255 aa  103  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  28.21 
 
 		 934 aa  102  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1259 aa  99.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1275 aa  99  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  30.49 
 
 		 902 aa  91.3  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  25.46 
 
 		 1271 aa  90.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5800  hypothetical protein  31.88 
 
 		 436 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000132526 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  27.03 
 
 		 636 aa  87.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  25.4 
 
 		 609 aa  87.8  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.44 
 
 		 752 aa  87.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5628  hypothetical protein  31.88 
 
 		 404 aa  87.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431962  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  25.51 
 
 		 464 aa  84  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  28.98 
 
 		 479 aa  81.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  29.34 
 
 		 901 aa  80.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  29.32 
 
 		 632 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  24.54 
 
 		 486 aa  80.1  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  26.29 
 
 		 1038 aa  80.5  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.49 
 
 		 932 aa  79.7  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  22.99 
 
 		 611 aa  79.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  24.44 
 
 		 635 aa  78.2  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  25.18 
 
 		 1111 aa  77.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  29.26 
 
 		 619 aa  75.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  27.6 
 
 		 636 aa  75.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  29.33 
 
 		 622 aa  75.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  28.6 
 
 		 622 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5419  hypothetical protein  28.8 
 
 		 439 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.472975 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  24.28 
 
 		 797 aa  74.3  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  28.33 
 
 		 659 aa  74.3  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  22.57 
 
 		 1097 aa  73.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  23.28 
 
 		 1077 aa  73.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2796  transcription factor jumonji, jmjC  42.86 
 
 		 193 aa  72.8  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132584  hitchhiker  0.00000604093 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  31.53 
 
 		 946 aa  73.2  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  24.27 
 
 		 1090 aa  71.2  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  23.19 
 
 		 633 aa  71.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  27.13 
 
 		 1427 aa  70.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  22.43 
 
 		 633 aa  68.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  28.9 
 
 		 553 aa  68.6  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  28.9 
 
 		 553 aa  68.6  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  24.21 
 
 		 922 aa  68.2  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  23.19 
 
 		 633 aa  68.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  25.72 
 
 		 2245 aa  67.8  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  21.92 
 
 		 585 aa  67.4  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  27.51 
 
 		 521 aa  67.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  26.52 
 
 		 1189 aa  66.6  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  25.54 
 
 		 1999 aa  66.6  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  28.24 
 
 		 928 aa  66.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4116  hypothetical protein  26.92 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  27.21 
 
 		 2002 aa  65.1  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  25.27 
 
 		 1653 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  28.57 
 
 		 1185 aa  64.3  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  25.06 
 
 		 686 aa  63.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3484  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.71 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  24.27 
 
 		 716 aa  63.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  27.57 
 
 		 1190 aa  62  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  27.56 
 
 		 651 aa  61.6  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  24.63 
 
 		 916 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1018 aa  61.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.65 
 
 		 1203 aa  61.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  25.84 
 
 		 1754 aa  60.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  26.48 
 
 		 1585 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  26.48 
 
 		 1585 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  26.87 
 
 		 1048 aa  59.7  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  28.57 
 
 		 1983 aa  59.7  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  25.93 
 
 		 650 aa  60.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  19.52 
 
 		 1002 aa  59.3  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.69 
 
 		 1196 aa  59.3  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.66 
 
 		 1986 aa  59.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  25.19 
 
 		 795 aa  59.3  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  26.2 
 
 		 650 aa  59.3  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  25.9 
 
 		 754 aa  59.3  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  24.22 
 
 		 1126 aa  58.9  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>