60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5628 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008704  Mkms_5800  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  798    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000132526 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5628  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  796    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431962  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5419  hypothetical protein  74.94 
 
 		 439 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.472975 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3484  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  54.55 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4116  hypothetical protein  33.98 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2673  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  35.03 
 
 		 448 aa  145  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000150277  normal  0.0245588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1482  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  33.25 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3949  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  31.23 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0000319399  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5369  hypothetical protein  31.65 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.974948  normal  0.108224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1350 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1215 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  29.64 
 
 		 1247 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1118 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  30.89 
 
 		 1280 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  29.12 
 
 		 1250 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  29.52 
 
 		 1228 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  28.09 
 
 		 1270 aa  68.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  29.78 
 
 		 1175 aa  66.6  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  28 
 
 		 1153 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  27.92 
 
 		 1196 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  23.06 
 
 		 1038 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1116 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  26.74 
 
 		 1151 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1139 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1126 aa  60.1  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.76 
 
 		 1324 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  25.56 
 
 		 1082 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  26.12 
 
 		 1163 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1215 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  26.46 
 
 		 941 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  30.47 
 
 		 1198 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  23.33 
 
 		 1255 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1121 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  25.26 
 
 		 1143 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  25.26 
 
 		 1143 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  26.26 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  24.28 
 
 		 1143 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  28.41 
 
 		 659 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1018 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  21.78 
 
 		 609 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  30.48 
 
 		 2002 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  25.58 
 
 		 902 aa  49.7  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  38.64 
 
 		 619 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  23.77 
 
 		 1999 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  24.3 
 
 		 1185 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  37.5 
 
 		 622 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  37.5 
 
 		 622 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1176 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  22.29 
 
 		 914 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  24.57 
 
 		 1585 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  24.57 
 
 		 1585 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  24.39 
 
 		 1651 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  25.07 
 
 		 986 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  26.98 
 
 		 651 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  32.18 
 
 		 748 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  28.2 
 
 		 901 aa  43.9  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  24.38 
 
 		 606 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  25.59 
 
 		 934 aa  43.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  22.18 
 
 		 635 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  26.91 
 
 		 1523 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>