27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5369 on replicon NC_011880
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011880  Cyan7425_5369  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  926    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.974948  normal  0.108224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3949  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  39.01 
 
 
434 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0000319399  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1482  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  38.52 
 
 
450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548351  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5419  hypothetical protein  31.7 
 
 
439 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.472975 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5628  hypothetical protein  32.11 
 
 
404 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431962  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5800  hypothetical protein  31.65 
 
 
436 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000132526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2673  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  31.78 
 
 
448 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000150277  normal  0.0245588 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4116  hypothetical protein  27.72 
 
 
434 aa  96.3  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3484  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.86 
 
 
429 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  26.29 
 
 
1270 aa  79.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  26.92 
 
 
1228 aa  73.6  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  24.67 
 
 
1250 aa  71.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  26.26 
 
 
1215 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.01 
 
 
1324 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  25.56 
 
 
1215 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  24.47 
 
 
1247 aa  60.1  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  25.67 
 
 
1196 aa  58.9  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  23.08 
 
 
986 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  25.25 
 
 
1350 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  26.32 
 
 
1139 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  24.51 
 
 
606 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  25.12 
 
 
1153 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  28.16 
 
 
1163 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  23.17 
 
 
902 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  27.78 
 
 
1280 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.42 
 
 
752 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  27.04 
 
 
1151 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>