125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0739 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  58.41 
 
 
1065 aa  743  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  57.88 
 
 
618 aa  725  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  3.85209e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  62.48 
 
 
773 aa  758  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  54.08 
 
 
787 aa  665  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  57.66 
 
 
744 aa  685  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  65.98 
 
 
820 aa  788  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  53.33 
 
 
672 aa  664  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  61.37 
 
 
743 aa  723  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  55.52 
 
 
746 aa  658  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  54.32 
 
 
677 aa  665  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  6.68501e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  57.43 
 
 
1266 aa  750  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  57.05 
 
 
914 aa  711  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  62.71 
 
 
833 aa  782  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  100 
 
 
676 aa  1384  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  5.88173e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  54.67 
 
 
1880 aa  675  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  52.33 
 
 
662 aa  629  1e-179  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  51.72 
 
 
658 aa  615  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  50.98 
 
 
613 aa  610  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  54.93 
 
 
774 aa  602  1e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  59.71 
 
 
669 aa  580  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  49.22 
 
 
616 aa  577  1e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  40.49 
 
 
848 aa  406  1e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  34.2 
 
 
1082 aa  313  5e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  36.77 
 
 
851 aa  313  6e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  36.35 
 
 
767 aa  296  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  40.76 
 
 
803 aa  289  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  33.07 
 
 
606 aa  265  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  54.36 
 
 
240 aa  254  4e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  48.24 
 
 
737 aa  79  3e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  66.67 
 
 
757 aa  72.4  2e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  50.62 
 
 
534 aa  73.2  2e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  48.05 
 
 
552 aa  71.2  5e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  63.16 
 
 
722 aa  70.9  7e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  59.26 
 
 
584 aa  67.8  7e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  54.1 
 
 
725 aa  65.5  3e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  45.78 
 
 
873 aa  65.1  4e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  50 
 
 
460 aa  63.9  9e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  53.7 
 
 
780 aa  63.2  1e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  49.18 
 
 
536 aa  62  3e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  48.39 
 
 
482 aa  61.2  5e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  57.89 
 
 
949 aa  61.2  6e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  49.18 
 
 
462 aa  61.2  6e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  57.38 
 
 
951 aa  60.8  7e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  53.7 
 
 
715 aa  60.8  8e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  58.18 
 
 
885 aa  60.8  8e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  46.27 
 
 
477 aa  60.8  8e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  4.71564e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  50 
 
 
526 aa  60.5  1e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  6.24089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  51.85 
 
 
604 aa  59.7  2e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  51.85 
 
 
1122 aa  59.3  2e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  31.3 
 
 
563 aa  59.7  2e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.15938e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  47.54 
 
 
541 aa  59.3  3e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  46.3 
 
 
746 aa  58.5  4e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  51.56 
 
 
490 aa  58.5  4e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  50 
 
 
621 aa  58.2  5e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  50 
 
 
539 aa  58.2  5e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  49.28 
 
 
686 aa  58.2  5e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.27885e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  44.44 
 
 
955 aa  57.8  6e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  50 
 
 
311 aa  56.6  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  48.44 
 
 
308 aa  56.6  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  53.7 
 
 
874 aa  56.6  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  51.85 
 
 
1015 aa  57  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.98242e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  39.73 
 
 
295 aa  55.5  3e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  39.08 
 
 
334 aa  55.1  4e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  33.7 
 
 
423 aa  54.7  5e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  42.25 
 
 
425 aa  53.1  1e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 
619 aa  53.5  1e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  47.54 
 
 
475 aa  53.9  1e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.75 
 
 
411 aa  53.9  1e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  37.04 
 
 
298 aa  53.1  2e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.69346e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  39.68 
 
 
773 aa  52.8  2e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  42.37 
 
 
741 aa  52.8  2e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2353  hypothetical protein  23.92 
 
 
667 aa  52.4  3e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  45.76 
 
 
560 aa  52.4  3e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  40.3 
 
 
583 aa  52.4  3e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.98696e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  41.18 
 
 
509 aa  51.6  4e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  45.45 
 
 
524 aa  52  4e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 
477 aa  51.6  4e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.64 
 
 
528 aa  51.6  5e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  49.15 
 
 
316 aa  51.6  5e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  41.82 
 
 
895 aa  50.8  8e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  48.21 
 
 
436 aa  50.8  9e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  50.82 
 
 
1164 aa  50.4  9e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  41.07 
 
 
590 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 
1224 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  48.15 
 
 
303 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  44.83 
 
 
532 aa  50.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  40.3 
 
 
630 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  38.46 
 
 
554 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  45.61 
 
 
730 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  44.64 
 
 
710 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  34.55 
 
 
707 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.61631e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  48.28 
 
 
965 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  37.84 
 
 
580 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  29.31 
 
 
471 aa  48.9  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  40.3 
 
 
861 aa  48.5  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  46.67 
 
 
646 aa  48.5  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0736  cellulosome protein dockerin type I  48.28 
 
 
424 aa  47.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00031925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.84 
 
 
790 aa  47.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  40.98 
 
 
412 aa  47.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  43.55 
 
 
833 aa  47.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>