72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0086 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0086  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
680 aa  1375  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0291  NHL repeat-containing protein  33.18 
 
 
669 aa  360  3e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1595  hypothetical protein  34.31 
 
 
540 aa  329  1e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0177  NHL repeat containing protein  29.33 
 
 
716 aa  287  6e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1591  NHL repeat containing protein  27.9 
 
 
686 aa  242  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.24269  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  26.01 
 
 
668 aa  82.8  2e-14  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  25.94 
 
 
676 aa  81.6  4e-14  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  27.27 
 
 
522 aa  80.9  7e-14  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  26.21 
 
 
627 aa  73.2  2e-11  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  24.36 
 
 
1293 aa  71.6  5e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  23.02 
 
 
930 aa  71.2  6e-11  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  26.95 
 
 
930 aa  69.7  2e-10  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  25.67 
 
 
831 aa  68.9  3e-10  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  26.42 
 
 
346 aa  67.8  6e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  23.2 
 
 
752 aa  65.1  4e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  30.77 
 
 
307 aa  62  4e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  22.8 
 
 
588 aa  61.6  4e-08  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.75 
 
 
709 aa  61.6  5e-08  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  23.05 
 
 
579 aa  60.8  7e-08  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  30.19 
 
 
1163 aa  60.5  1e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.39 
 
 
343 aa  60.1  1e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  22.85 
 
 
1177 aa  60.1  1e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  25.55 
 
 
396 aa  58.9  3e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  34.17 
 
 
1030 aa  58.9  3e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  28.45 
 
 
359 aa  58.5  4e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  30.49 
 
 
364 aa  57.8  6e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  33.9 
 
 
368 aa  58.2  6e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  34.58 
 
 
384 aa  57.8  7e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  32.79 
 
 
391 aa  57  1e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  30.09 
 
 
1146 aa  56.6  2e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  31.58 
 
 
379 aa  55.5  3e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  30 
 
 
639 aa  55.5  4e-06  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  31.03 
 
 
334 aa  54.3  7e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  26.69 
 
 
491 aa  54.3  7e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  33.86 
 
 
343 aa  54.3  8e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  7.62607e-06 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  27.69 
 
 
700 aa  52.8  2e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  33.62 
 
 
387 aa  53.1  2e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  32.95 
 
 
395 aa  52.8  2e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  27.68 
 
 
343 aa  52.4  3e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  23.14 
 
 
786 aa  51.2  6e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  42.47 
 
 
732 aa  51.2  6e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  26.62 
 
 
412 aa  51.2  7e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  30.7 
 
 
347 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  27.73 
 
 
1140 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  32.46 
 
 
353 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  27.1 
 
 
841 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  24.34 
 
 
360 aa  49.3  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.27539e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  32.14 
 
 
372 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 
418 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  33.9 
 
 
321 aa  48.5  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  30.47 
 
 
365 aa  47.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.23 
 
 
351 aa  47.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  27.87 
 
 
354 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  37.72 
 
 
664 aa  47  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  28.12 
 
 
328 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  23.4 
 
 
1068 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  28.46 
 
 
1026 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  31.58 
 
 
660 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 
850 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  25.26 
 
 
436 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  27.22 
 
 
355 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  28.79 
 
 
343 aa  45.8  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  23.74 
 
 
1750 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  27.43 
 
 
711 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  26.7 
 
 
447 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  34.51 
 
 
390 aa  44.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  29.51 
 
 
1079 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  28.12 
 
 
279 aa  44.3  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  27.15 
 
 
322 aa  44.3  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  39.19 
 
 
770 aa  44.3  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.95 
 
 
693 aa  44.3  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.92 
 
 
1292 aa  43.9  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>