More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02940 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  72.71 
 
 
481 aa  659    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02940  centromere/microtubule binding protein cbf5, putative  100 
 
 
503 aa  1028    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701159  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64832  nucleolar pseuduridine synthase and putative microtubule binding protein  77.08 
 
 
475 aa  650    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20773  predicted protein  67.65 
 
 
484 aa  616  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30197  predicted protein  75.14 
 
 
411 aa  547  1e-154  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  48.69 
 
 
321 aa  292  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  44.69 
 
 
338 aa  288  2e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0082  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.79 
 
 
338 aa  273  6e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576501  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0988  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  44.55 
 
 
359 aa  272  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0028  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.14 
 
 
331 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000488795  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0961  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.17 
 
 
333 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0985  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.17 
 
 
333 aa  257  4e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0128242  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1720  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.5 
 
 
333 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.48 
 
 
335 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1222  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40 
 
 
331 aa  246  9e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.22 
 
 
331 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0406  pseudouridylate synthase subunit TruB  41.19 
 
 
332 aa  242  1e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.31 
 
 
328 aa  242  1e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.99 
 
 
333 aa  241  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  39.74 
 
 
331 aa  238  3e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1369  pseudouridylate synthase TruB domain protein  41.22 
 
 
251 aa  212  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.862548  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1494  pseudouridylate synthase TruB domain protein  39.4 
 
 
286 aa  210  6e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0538  pseudouridylate synthase  40.61 
 
 
302 aa  209  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0902248  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  39.74 
 
 
310 aa  206  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2322  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  36.15 
 
 
295 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.713223  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2750  pseudouridylate synthase TruB domain protein  39.25 
 
 
299 aa  187  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0513  pseudouridylate synthase  37.67 
 
 
322 aa  184  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1733  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  35.29 
 
 
299 aa  183  6e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.17014 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0057  PUA domain-containing protein  40.52 
 
 
233 aa  178  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.510728 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0072  hypothetical protein  37.86 
 
 
282 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00484212 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2256  pseudouridylate synthase TruB domain protein  37.14 
 
 
304 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0271  pseudouridylate synthase TruB domain protein  33.86 
 
 
314 aa  163  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1812  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  34.48 
 
 
343 aa  160  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.572421  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  31.42 
 
 
302 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  29.97 
 
 
302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  38.69 
 
 
294 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  35.15 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  35.15 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  30.42 
 
 
309 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  29.04 
 
 
309 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  35.15 
 
 
307 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  36.32 
 
 
303 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  35.15 
 
 
307 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  30.57 
 
 
307 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  34.65 
 
 
307 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  34.3 
 
 
302 aa  108  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  30.04 
 
 
309 aa  107  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  34.16 
 
 
307 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  33.66 
 
 
307 aa  107  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  34.16 
 
 
307 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  33.66 
 
 
307 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  33.8 
 
 
322 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  29.26 
 
 
310 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  34.16 
 
 
307 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  27.08 
 
 
294 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  30.42 
 
 
297 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  35.35 
 
 
292 aa  101  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  33.66 
 
 
299 aa  101  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2009  tRNA pseudouridine synthase B  34.67 
 
 
347 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.845229  normal  0.607065 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  29.06 
 
 
322 aa  99.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  28.87 
 
 
309 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08010  tRNA pseudouridine 55 synthase  30.19 
 
 
340 aa  99.4  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.608305 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  31.03 
 
 
330 aa  99.8  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  28.28 
 
 
305 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  33.5 
 
 
293 aa  99.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1703  tRNA pseudouridine synthase B  34.27 
 
 
339 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149412 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  28.28 
 
 
305 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0701  tRNA pseudouridine synthase B  32.54 
 
 
301 aa  98.6  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0781617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  34.69 
 
 
314 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  32.81 
 
 
280 aa  99.4  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  33.83 
 
 
336 aa  98.6  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  32.34 
 
 
299 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  32.84 
 
 
297 aa  98.2  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  30.41 
 
 
299 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  33.66 
 
 
306 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  35.03 
 
 
303 aa  98.2  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  29.01 
 
 
300 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  32.66 
 
 
298 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  32.68 
 
 
295 aa  97.8  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  28.47 
 
 
295 aa  97.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  29.81 
 
 
310 aa  97.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  31.54 
 
 
302 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  35.18 
 
 
305 aa  97.1  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  36.22 
 
 
304 aa  97.1  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  32.2 
 
 
314 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  33 
 
 
310 aa  97.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  33 
 
 
313 aa  97.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  28.68 
 
 
305 aa  96.7  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  31.47 
 
 
306 aa  96.7  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  31.9 
 
 
304 aa  96.7  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  32.49 
 
 
297 aa  96.7  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  31.15 
 
 
311 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  32.2 
 
 
314 aa  96.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1862  tRNA pseudouridine synthase B  30.63 
 
 
313 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.552372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2428  tRNA pseudouridine synthase B  33.2 
 
 
337 aa  96.3  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36134  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  31.18 
 
 
307 aa  96.3  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0629  tRNA pseudouridine synthase B  28.86 
 
 
317 aa  96.3  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  32 
 
 
299 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  29.59 
 
 
307 aa  96.3  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  31.15 
 
 
302 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>