More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0977 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  100 
 
 
471 aa  920    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  59.96 
 
 
468 aa  555  1e-157  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  60.17 
 
 
467 aa  542  1e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  60.21 
 
 
471 aa  530  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  57.69 
 
 
472 aa  510  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  56.64 
 
 
472 aa  499  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  54.77 
 
 
472 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  55.19 
 
 
472 aa  484  1e-135  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  54.98 
 
 
472 aa  482  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  49.57 
 
 
461 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.87 
 
 
513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  38.56 
 
 
476 aa  322  7e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  41.4 
 
 
465 aa  317  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  41.05 
 
 
511 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  43.75 
 
 
502 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  37.47 
 
 
457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  39.37 
 
 
460 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  36.55 
 
 
473 aa  307  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  40.19 
 
 
504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  37.44 
 
 
458 aa  304  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  41.23 
 
 
479 aa  302  9e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.93 
 
 
398 aa  300  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  38.14 
 
 
476 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.95 
 
 
442 aa  298  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  45.95 
 
 
442 aa  298  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  37.55 
 
 
506 aa  295  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  37.8 
 
 
474 aa  295  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  37.5 
 
 
498 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  40.14 
 
 
502 aa  294  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  37.8 
 
 
474 aa  295  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  36.64 
 
 
463 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.19 
 
 
464 aa  292  9e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  38.97 
 
 
471 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.79 
 
 
457 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  36.07 
 
 
464 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  38.53 
 
 
476 aa  290  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  38.34 
 
 
450 aa  290  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  38.81 
 
 
450 aa  289  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  38.81 
 
 
450 aa  289  6e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  39.08 
 
 
476 aa  289  7e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  37.31 
 
 
450 aa  289  7e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  37.87 
 
 
505 aa  289  9e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  43.4 
 
 
383 aa  289  9e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  38.06 
 
 
471 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  41.07 
 
 
459 aa  288  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  38.58 
 
 
450 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  40.53 
 
 
469 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  43.13 
 
 
385 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  37.23 
 
 
463 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  39.23 
 
 
451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  39.9 
 
 
497 aa  286  4e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  44.62 
 
 
383 aa  286  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  36.43 
 
 
468 aa  286  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  38.74 
 
 
485 aa  286  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.41 
 
 
412 aa  286  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  39.35 
 
 
453 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  38.5 
 
 
474 aa  286  8e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.11 
 
 
396 aa  285  9e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  44.9 
 
 
380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  40.38 
 
 
458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  36.82 
 
 
500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  36.59 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  37.41 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  38.52 
 
 
476 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  37.44 
 
 
487 aa  285  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  36.15 
 
 
476 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  38.27 
 
 
474 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  42.9 
 
 
396 aa  283  5.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  38.12 
 
 
451 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.96 
 
 
379 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  37.22 
 
 
450 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  37.22 
 
 
450 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  37.22 
 
 
450 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  42.42 
 
 
443 aa  282  8.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  42.03 
 
 
458 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  37.07 
 
 
499 aa  282  9e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  46.56 
 
 
393 aa  282  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  48.56 
 
 
386 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  37.05 
 
 
467 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.2 
 
 
398 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  34.85 
 
 
496 aa  280  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  43.7 
 
 
457 aa  281  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  43.7 
 
 
463 aa  280  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  43.7 
 
 
457 aa  281  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  37 
 
 
450 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  44.97 
 
 
474 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  35.57 
 
 
450 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  41.64 
 
 
386 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  39.13 
 
 
511 aa  280  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  44.97 
 
 
474 aa  279  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  44.97 
 
 
474 aa  279  7e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  44.97 
 
 
474 aa  279  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  44.97 
 
 
474 aa  279  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  38.32 
 
 
449 aa  279  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  44.97 
 
 
474 aa  279  8e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  35.74 
 
 
474 aa  279  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  44.97 
 
 
474 aa  279  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  42.28 
 
 
464 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  44.97 
 
 
474 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  36.67 
 
 
524 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>