More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0421 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 
260 aa  541  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  87.76 
 
 
245 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  87.35 
 
 
245 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  86.53 
 
 
245 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  86.53 
 
 
245 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  86.53 
 
 
245 aa  447  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  86.53 
 
 
245 aa  447  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  87.35 
 
 
245 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  86.53 
 
 
245 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  85.31 
 
 
245 aa  447  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  87.35 
 
 
245 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  46.77 
 
 
248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  46.37 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  46.34 
 
 
245 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  43.21 
 
 
244 aa  217  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  43.27 
 
 
244 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0879  tRNA pseudouridine synthase A  44.13 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  41.91 
 
 
246 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  41.91 
 
 
246 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  43.03 
 
 
244 aa  203  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  39.27 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  45.53 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  45.53 
 
 
244 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  39.68 
 
 
247 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  41.11 
 
 
252 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  40.71 
 
 
252 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  40.71 
 
 
252 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  39.02 
 
 
246 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  40.65 
 
 
247 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  40.65 
 
 
247 aa  185  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  40.65 
 
 
247 aa  185  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  40.65 
 
 
247 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  40 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  40.24 
 
 
247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  40.32 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  35.92 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  38.33 
 
 
264 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  40 
 
 
256 aa  181  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  39.51 
 
 
244 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  35.51 
 
 
252 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  39.43 
 
 
247 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  40.83 
 
 
248 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  37.7 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3066  tRNA pseudouridine synthase A  36.18 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301608  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  38.6 
 
 
247 aa  178  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  38.16 
 
 
250 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0447  tRNA pseudouridine synthase A  35.37 
 
 
249 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.801238 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0126  tRNA pseudouridine synthase A  38.19 
 
 
264 aa  175  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  39.17 
 
 
258 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  36.22 
 
 
255 aa  175  8e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  37.29 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  37.29 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  34.55 
 
 
245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3695  tRNA pseudouridine synthase A  35.77 
 
 
245 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0391  tRNA pseudouridine synthase A  37.9 
 
 
247 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4238  tRNA pseudouridine synthase A  35.77 
 
 
250 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00146243 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0974  tRNA pseudouridine synthase A  36.69 
 
 
251 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1033  tRNA pseudouridine synthase A  36.69 
 
 
251 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  39.02 
 
 
261 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2251  tRNA pseudouridine synthase A  39.18 
 
 
246 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218051  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  41.1 
 
 
245 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 
248 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  36.63 
 
 
262 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  37.45 
 
 
270 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  36.25 
 
 
261 aa  169  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1916  tRNA pseudouridine synthase A  36.8 
 
 
250 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3148  tRNA pseudouridine synthase A  34.8 
 
 
253 aa  168  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733437  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0622  tRNA pseudouridine synthase A  39.18 
 
 
245 aa  168  7e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.939748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1346  tRNA pseudouridine synthase A  36.29 
 
 
251 aa  168  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.31 
 
 
245 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1321  tRNA pseudouridine synthase A  35.48 
 
 
247 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  36.67 
 
 
261 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  39.43 
 
 
264 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  32.24 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  38.87 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1600  tRNA pseudouridine synthase A  36.76 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535619  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1617  tRNA pseudouridine synthase A  37.08 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0232986  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0540  tRNA pseudouridine synthase A  35.89 
 
 
259 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.999285  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0263  tRNA pseudouridine synthase A  36.18 
 
 
246 aa  165  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1634  tRNA pseudouridine synthase A  35.97 
 
 
250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 
252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  37.5 
 
 
245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0498  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 
260 aa  165  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276937  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  36.95 
 
 
250 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  33.06 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  34.69 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3382  tRNA pseudouridine synthase A  35.1 
 
 
244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000753277  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2717  tRNA pseudouridine synthase A  36.48 
 
 
287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0374382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  34.66 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0770  tRNA pseudouridine synthase A  34.54 
 
 
275 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2867  tRNA pseudouridine synthase A  35 
 
 
270 aa  162  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.42429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  31.84 
 
 
270 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  35.54 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.46 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0223  tRNA pseudouridine synthase A  36.51 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00472694  normal  0.027676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0226  tRNA pseudouridine synthase A  36.51 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2019  tRNA pseudouridine synthase A  33.06 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0292827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>