144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0250 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  41.61 
 
 		 1215 aa  827    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  36.68 
 
 		 1247 aa  643    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  40.13 
 
 		 1270 aa  739    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  100 
 
 		 1350 aa  2666    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  46.77 
 
 		 1250 aa  1003    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  41.92 
 
 		 1215 aa  824    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  47.04 
 
 		 1139 aa  521  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  45.94 
 
 		 1151 aa  505  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  45.02 
 
 		 1143 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  45.02 
 
 		 1143 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  44.31 
 
 		 1163 aa  499  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  45.02 
 
 		 1143 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  46.92 
 
 		 1228 aa  488  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  45.35 
 
 		 1324 aa  446  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  44.27 
 
 		 1196 aa  402  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  39.73 
 
 		 522 aa  340  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  39.24 
 
 		 1153 aa  320  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  38.4 
 
 		 1280 aa  315  4.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  37.46 
 
 		 1198 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  40.36 
 
 		 1175 aa  277  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  30.76 
 
 		 1118 aa  239  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1172 aa  221  6e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  33.39 
 
 		 1082 aa  220  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  29 
 
 		 1126 aa  214  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1116 aa  209  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  37.53 
 
 		 1121 aa  204  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  27.81 
 
 		 606 aa  97.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  26.04 
 
 		 1271 aa  95.1  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  24.06 
 
 		 1090 aa  93.6  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  28.71 
 
 		 934 aa  90.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  23.31 
 
 		 635 aa  87  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  24.31 
 
 		 1038 aa  86.3  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  23.53 
 
 		 1077 aa  84.7  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  29.41 
 
 		 902 aa  84.3  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1259 aa  84.7  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  26.09 
 
 		 902 aa  83.2  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  25.24 
 
 		 797 aa  82.8  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1275 aa  79.3  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  24.01 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  28.8 
 
 		 553 aa  78.6  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  28.8 
 
 		 553 aa  78.6  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  28.2 
 
 		 986 aa  78.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  27.33 
 
 		 901 aa  77.8  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  23.19 
 
 		 636 aa  75.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  21.1 
 
 		 1099 aa  75.5  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.27 
 
 		 932 aa  75.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  29.41 
 
 		 464 aa  73.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5628  hypothetical protein  28.42 
 
 		 404 aa  73.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431962  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5800  hypothetical protein  28.42 
 
 		 436 aa  73.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000132526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  24.63 
 
 		 1255 aa  73.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  29.49 
 
 		 659 aa  73.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  25.69 
 
 		 922 aa  73.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  26.46 
 
 		 521 aa  71.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  24 
 
 		 493 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  24 
 
 		 493 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  22.99 
 
 		 715 aa  70.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  25.38 
 
 		 1585 aa  69.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  22.65 
 
 		 1653 aa  69.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  25.38 
 
 		 1585 aa  69.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  23.23 
 
 		 494 aa  67.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  25.66 
 
 		 1121 aa  67.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  28.11 
 
 		 1620 aa  66.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  21.64 
 
 		 585 aa  66.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  23.8 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  23.57 
 
 		 916 aa  65.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  28.26 
 
 		 1189 aa  65.5  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  21.73 
 
 		 636 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  22.2 
 
 		 611 aa  63.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  22.76 
 
 		 629 aa  63.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  23.98 
 
 		 1408 aa  62.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  23.27 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.77 
 
 		 752 aa  62  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  24.53 
 
 		 1048 aa  61.6  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  22.97 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  24.42 
 
 		 686 aa  60.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2796  transcription factor jumonji, jmjC  44.59 
 
 		 193 aa  60.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132584  hitchhiker  0.00000604093 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  26.43 
 
 		 535 aa  60.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  20 
 
 		 655 aa  60.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  24.01 
 
 		 2245 aa  60.1  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  21.56 
 
 		 633 aa  60.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  23.96 
 
 		 1584 aa  60.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  21.85 
 
 		 512 aa  59.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  26.03 
 
 		 609 aa  58.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  24.01 
 
 		 479 aa  58.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5419  hypothetical protein  30.8 
 
 		 439 aa  57.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.472975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  19.86 
 
 		 632 aa  57.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  25.19 
 
 		 946 aa  56.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  36.54 
 
 		 237 aa  56.6  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  25.5 
 
 		 748 aa  56.2  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  38.95 
 
 		 1190 aa  56.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  36.71 
 
 		 716 aa  56.2  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  25.52 
 
 		 491 aa  55.8  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  28.39 
 
 		 390 aa  55.8  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  21.59 
 
 		 643 aa  55.8  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  24.05 
 
 		 925 aa  55.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.02 
 
 		 1428 aa  55.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.3 
 
 		 1203 aa  55.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  24.2 
 
 		 388 aa  55.5  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  22.41 
 
 		 1111 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1080  AAA ATPase  27.36 
 
 		 1136 aa  55.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>