59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5419 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5419  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  868    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.472975 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5628  hypothetical protein  74.94 
 
 		 404 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431962  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5800  hypothetical protein  74.94 
 
 		 436 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000132526 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3484  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  52.66 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4116  hypothetical protein  33.01 
 
 		 434 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2673  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  32.35 
 
 		 448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000150277  normal  0.0245588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1482  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.18 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3949  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.63 
 
 		 434 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0000319399  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5369  hypothetical protein  31.62 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.974948  normal  0.108224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1215 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1350 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  28.18 
 
 		 1153 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  26.46 
 
 		 1151 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  30.8 
 
 		 1280 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  22.66 
 
 		 1038 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  26.45 
 
 		 902 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1247 aa  57.4  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  24.17 
 
 		 1255 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1118 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1116 aa  54.3  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  27.25 
 
 		 1228 aa  54.3  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  25.97 
 
 		 1270 aa  53.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1175 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  24.92 
 
 		 914 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.2 
 
 		 1324 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  24.77 
 
 		 1271 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  24.86 
 
 		 1082 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1126 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  25.82 
 
 		 479 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  23.62 
 
 		 629 aa  50.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  27.49 
 
 		 1198 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1176 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  29.55 
 
 		 1196 aa  50.4  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  21.51 
 
 		 609 aa  50.1  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  29.75 
 
 		 619 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1139 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  29.39 
 
 		 622 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  28.46 
 
 		 986 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  29.39 
 
 		 622 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  28.36 
 
 		 902 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  27.01 
 
 		 941 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 		 1196 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  24.4 
 
 		 1143 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  27.13 
 
 		 1250 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  24.4 
 
 		 1143 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  24.3 
 
 		 606 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  23.98 
 
 		 1143 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  21.66 
 
 		 650 aa  46.6  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  27.52 
 
 		 934 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  28.06 
 
 		 651 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  21.3 
 
 		 650 aa  45.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  32.61 
 
 		 636 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  26.42 
 
 		 632 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  31.33 
 
 		 748 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  32.08 
 
 		 2002 aa  43.5  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  23.4 
 
 		 1185 aa  43.5  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1215 aa  43.1  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  56.25 
 
 		 1092 aa  43.1  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  23.55 
 
 		 1999 aa  43.1  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>