43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1482 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1482  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  100 
 
 		 450 aa  891    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3949  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  60.53 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0000319399  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5369  hypothetical protein  38.52 
 
 		 454 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.974948  normal  0.108224 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3484  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.29 
 
 		 429 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5628  hypothetical protein  33.09 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431962  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5800  hypothetical protein  33.09 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000132526 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5419  hypothetical protein  34.94 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.472975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2673  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  31.94 
 
 		 448 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000150277  normal  0.0245588 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4116  hypothetical protein  28.34 
 
 		 434 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  27.18 
 
 		 986 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  26.24 
 
 		 1196 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  26.36 
 
 		 934 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  26.4 
 
 		 902 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  28.42 
 
 		 1228 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  26.09 
 
 		 1270 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  26.82 
 
 		 1271 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  27.23 
 
 		 622 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  21.46 
 
 		 797 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25 
 
 		 606 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  24.19 
 
 		 1250 aa  54.7  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  26.87 
 
 		 622 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1247 aa  54.3  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  24.88 
 
 		 1111 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  25.77 
 
 		 901 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  24.87 
 
 		 902 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  28.11 
 
 		 1018 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1350 aa  50.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  25.45 
 
 		 1153 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  25 
 
 		 1215 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1139 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  26.65 
 
 		 1082 aa  48.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  27.29 
 
 		 1259 aa  46.6  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  37.5 
 
 		 611 aa  46.6  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  29.28 
 
 		 619 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  35.64 
 
 		 635 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  28.87 
 
 		 941 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1116 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1215 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  20.79 
 
 		 1172 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  39.66 
 
 		 1284 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  36.49 
 
 		 636 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  29.49 
 
 		 1097 aa  43.9  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  27.5 
 
 		 636 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>