32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4116 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_4116  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  886    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2673  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  41.18 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000150277  normal  0.0245588 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5800  hypothetical protein  33.81 
 
 		 436 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000132526 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5628  hypothetical protein  33.98 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431962  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3484  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  35.29 
 
 		 429 aa  167  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5419  hypothetical protein  32.54 
 
 		 439 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.472975 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5369  hypothetical protein  27.72 
 
 		 454 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.974948  normal  0.108224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3949  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.03 
 
 		 434 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0000319399  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1482  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.18 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548351  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  26.09 
 
 		 1196 aa  61.2  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1139 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  29.67 
 
 		 1038 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.83 
 
 		 1324 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  24.92 
 
 		 1250 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  24.93 
 
 		 1163 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  25.54 
 
 		 1151 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  25.8 
 
 		 986 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  25.77 
 
 		 1255 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  24.7 
 
 		 1153 aa  49.7  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  24.86 
 
 		 902 aa  47.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1936  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.46 
 
 		 1251 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  28.37 
 
 		 606 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  25.63 
 
 		 1198 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  26.67 
 
 		 1270 aa  45.8  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  27.75 
 
 		 1228 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1247 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  27.08 
 
 		 1280 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1350 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2420  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.87 
 
 		 1238 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415139  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  22.77 
 
 		 902 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  28.7 
 
 		 636 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  30 
 
 		 632 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>