46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2673 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2673  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  100 
 
 		 448 aa  890    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000150277  normal  0.0245588 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4116  hypothetical protein  41.72 
 
 		 434 aa  270  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3484  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  42.51 
 
 		 429 aa  186  8e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5800  hypothetical protein  34.46 
 
 		 436 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000132526 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5628  hypothetical protein  34.76 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431962  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5419  hypothetical protein  31.82 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.472975 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5369  hypothetical protein  31.78 
 
 		 454 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.974948  normal  0.108224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1482  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  31.22 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3949  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.1 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0000319399  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1215 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  26.02 
 
 		 986 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  30.06 
 
 		 1250 aa  67.4  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  28.44 
 
 		 1270 aa  66.6  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  26.22 
 
 		 902 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  28.42 
 
 		 902 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  26.94 
 
 		 934 aa  65.1  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  29.55 
 
 		 1196 aa  64.3  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1247 aa  61.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  28.57 
 
 		 1038 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  26.82 
 
 		 901 aa  58.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.4 
 
 		 752 aa  57  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  26.82 
 
 		 622 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  25.57 
 
 		 609 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1139 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  27.14 
 
 		 1151 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.09 
 
 		 1324 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  26.09 
 
 		 1153 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  29.72 
 
 		 1228 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1350 aa  50.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  25.28 
 
 		 521 aa  50.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  27 
 
 		 622 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  27.75 
 
 		 1280 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1215 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1121 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  26.9 
 
 		 1163 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  26.1 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  35 
 
 		 636 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  34.48 
 
 		 1143 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  26.25 
 
 		 464 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  35.34 
 
 		 1143 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  24.36 
 
 		 606 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  35.34 
 
 		 1143 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  28.96 
 
 		 619 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  26.54 
 
 		 1097 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  33.33 
 
 		 716 aa  43.5  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  20.72 
 
 		 635 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>