39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3484 on replicon NC_013531
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013531  Xcel_3484  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  100 
 
 		 429 aa  818    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5419  hypothetical protein  52.66 
 
 		 439 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.472975 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5628  hypothetical protein  54.8 
 
 		 404 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431962  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5800  hypothetical protein  54.8 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000132526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2673  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  40.4 
 
 		 448 aa  194  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000150277  normal  0.0245588 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4116  hypothetical protein  35.94 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1482  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.46 
 
 		 450 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3949  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  32.15 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0000319399  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5369  hypothetical protein  29.92 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.974948  normal  0.108224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1215 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  27.7 
 
 		 1250 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1350 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1215 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  24.65 
 
 		 1151 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  28.15 
 
 		 1270 aa  62.4  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  29.83 
 
 		 941 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  28.41 
 
 		 1196 aa  61.2  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1116 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  30.77 
 
 		 1280 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  27.85 
 
 		 1082 aa  56.6  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1118 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1247 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.87 
 
 		 1324 aa  54.7  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  26.51 
 
 		 1153 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  24.23 
 
 		 1038 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  28.37 
 
 		 1143 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1139 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  27.61 
 
 		 1143 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  27.61 
 
 		 1143 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  31.96 
 
 		 1175 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  27.99 
 
 		 1198 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1126 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1121 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  24.32 
 
 		 1163 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25.24 
 
 		 606 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  23.7 
 
 		 1271 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  29.26 
 
 		 1694 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  35.23 
 
 		 622 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  35.23 
 
 		 619 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>