126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1878 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  69.46 
 
 		 559 aa  782    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  100 
 
 		 539 aa  1121    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.91 
 
 		 536 aa  501  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.58 
 
 		 539 aa  478  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  43.78 
 
 		 523 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  44.9 
 
 		 532 aa  411  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.08 
 
 		 537 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  43.37 
 
 		 541 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  43.56 
 
 		 537 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.89 
 
 		 547 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  41.88 
 
 		 550 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.12 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  41.14 
 
 		 540 aa  385  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.13 
 
 		 546 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  39.74 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.28 
 
 		 558 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  31.43 
 
 		 553 aa  250  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  32.48 
 
 		 516 aa  246  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  31.24 
 
 		 552 aa  239  9e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  31.73 
 
 		 519 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.22 
 
 		 538 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 		 512 aa  219  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  33.02 
 
 		 517 aa  219  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  29.31 
 
 		 636 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.04 
 
 		 577 aa  201  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  37.06 
 
 		 497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  29.94 
 
 		 563 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  35.1 
 
 		 512 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  30.34 
 
 		 496 aa  193  7e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  30.45 
 
 		 581 aa  192  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.6 
 
 		 558 aa  189  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  39.22 
 
 		 488 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  29.04 
 
 		 566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  30.16 
 
 		 556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.8 
 
 		 546 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  36.65 
 
 		 586 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  34.42 
 
 		 484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 498 aa  179  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  38.16 
 
 		 497 aa  177  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.66 
 
 		 515 aa  173  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  31.86 
 
 		 542 aa  173  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  29.96 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  34.79 
 
 		 526 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 		 451 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 		 571 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  28.78 
 
 		 546 aa  157  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  27.9 
 
 		 591 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 547 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  28.64 
 
 		 537 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  27.4 
 
 		 650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  26.53 
 
 		 797 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.64 
 
 		 540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  28.4 
 
 		 537 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  29.21 
 
 		 511 aa  121  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.21 
 
 		 560 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  29.18 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 572 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  24.56 
 
 		 543 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 		 532 aa  113  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.2 
 
 		 562 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  28.15 
 
 		 525 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  27.98 
 
 		 590 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.1 
 
 		 536 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 		 534 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  23.94 
 
 		 545 aa  106  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  25.56 
 
 		 1338 aa  103  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  25.28 
 
 		 522 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 		 1195 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  25.65 
 
 		 518 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 		 504 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  31.25 
 
 		 551 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  24.52 
 
 		 665 aa  100  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  27.15 
 
 		 522 aa  99.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 522 aa  98.6  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  27.97 
 
 		 527 aa  96.7  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  25.75 
 
 		 1474 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  26.61 
 
 		 500 aa  93.6  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  26.63 
 
 		 746 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 521 aa  92.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  24.55 
 
 		 691 aa  88.2  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  29.15 
 
 		 508 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  24.79 
 
 		 503 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  24.66 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  26.91 
 
 		 530 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  23.12 
 
 		 522 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 		 518 aa  80.9  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.15 
 
 		 495 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  25.44 
 
 		 1585 aa  70.1  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  28.52 
 
 		 365 aa  69.7  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  25.62 
 
 		 532 aa  67  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  35.77 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  26.37 
 
 		 327 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  22.47 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  23.46 
 
 		 901 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  23.79 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  26.67 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  26.28 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.18 
 
 		 341 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 		 324 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  24.15 
 
 		 330 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>