146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0029 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 		 365 aa  761    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  69.86 
 
 		 365 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  69.59 
 
 		 365 aa  543  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  69.59 
 
 		 365 aa  543  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  68.77 
 
 		 365 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  68.49 
 
 		 389 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  66.3 
 
 		 365 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  67.12 
 
 		 365 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  66.03 
 
 		 365 aa  512  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  65.48 
 
 		 365 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  66.03 
 
 		 365 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  65.21 
 
 		 365 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  64.66 
 
 		 365 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  64.66 
 
 		 365 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  64.66 
 
 		 365 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  65.03 
 
 		 368 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  55.53 
 
 		 414 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  55.03 
 
 		 417 aa  435  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  57.78 
 
 		 379 aa  434  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  47.68 
 
 		 381 aa  349  6e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  46.32 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  46.87 
 
 		 377 aa  343  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  46.87 
 
 		 377 aa  342  7e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  46.45 
 
 		 376 aa  338  7e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  39.68 
 
 		 382 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  40.85 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  40.97 
 
 		 380 aa  265  8e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  38.87 
 
 		 376 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  38.36 
 
 		 400 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  37.1 
 
 		 378 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  37.97 
 
 		 384 aa  255  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  38.65 
 
 		 379 aa  255  7e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  37.43 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  37.7 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  39.11 
 
 		 399 aa  253  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  38.77 
 
 		 382 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  38.77 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  38.77 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.77 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  36.8 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  38.65 
 
 		 376 aa  249  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  37.04 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  37.17 
 
 		 397 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  35.16 
 
 		 391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  36.36 
 
 		 384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  36.65 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  36.36 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  35.56 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  37.27 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  35.9 
 
 		 408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  36.93 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  36.66 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  35.38 
 
 		 405 aa  232  9e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  37.7 
 
 		 380 aa  230  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  35.12 
 
 		 386 aa  225  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  33.92 
 
 		 406 aa  222  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  33.77 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.53 
 
 		 390 aa  215  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.68 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  34.41 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  33.67 
 
 		 400 aa  209  8e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.04 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  33.69 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  31.72 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  28.69 
 
 		 1055 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  28.69 
 
 		 1058 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  28.69 
 
 		 1086 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  28.69 
 
 		 1076 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  28.69 
 
 		 1113 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  28.69 
 
 		 1134 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  28.84 
 
 		 1110 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  26.14 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  25.38 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  24.11 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  21.95 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  23.77 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  22.78 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  22.1 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  21.97 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0279  diaminopimelate decarboxylase  23.33 
 
 		 451 aa  56.2  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  22.22 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2991  diaminopimelate decarboxylase  22.06 
 
 		 435 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000347646  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  22.68 
 
 		 416 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  23.67 
 
 		 421 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  21.72 
 
 		 427 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3753  diaminopimelate decarboxylase  27.86 
 
 		 432 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331776  normal  0.212108 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  20.11 
 
 		 394 aa  52.8  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07140  diaminopimelate decarboxylase  26.45 
 
 		 448 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.993125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1130  diaminopimelate decarboxylase  23.17 
 
 		 447 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.153124  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01670  diaminopimelate decarboxylase  21.32 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.209967  hitchhiker  0.000000000000581642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  23.55 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2093  diaminopimelate decarboxylase  23.31 
 
 		 484 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000338796  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2002  diaminopimelate decarboxylase  25.08 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1365  diaminopimelate decarboxylase  22.25 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00386973  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  22.77 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1461  diaminopimelate decarboxylase  22.37 
 
 		 421 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1490  diaminopimelate decarboxylase  22.37 
 
 		 421 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0425  diaminopimelate decarboxylase  24.05 
 
 		 393 aa  50.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  23.15 
 
 		 421 aa  49.7  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.788055 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>