More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0238 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 423 aa  869    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.6 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.39 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  27.63 
 
 		 424 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 444 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 495 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 429 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 441 aa  96.3  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.01 
 
 		 468 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.16 
 
 		 399 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  25.16 
 
 		 413 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 417 aa  94  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 461 aa  94  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.53 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.97 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.86 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 458 aa  92  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 478 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 422 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 		 466 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.61 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.33 
 
 		 419 aa  89.7  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.33 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 441 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 424 aa  86.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  21.13 
 
 		 419 aa  86.3  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.78 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  28.57 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  25.96 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  23.48 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.67 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.49 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  36.99 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 444 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  23.23 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  23.78 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.78 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>