More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3472 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  73.81 
 
 
516 aa  697    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  96.94 
 
 
523 aa  956    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
520 aa  1037    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  96.94 
 
 
523 aa  957    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  34.22 
 
 
1092 aa  206  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 
804 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
567 aa  191  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
852 aa  190  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  45.69 
 
 
592 aa  190  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 
592 aa  187  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
852 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 
495 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 
641 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.02 
 
 
819 aa  183  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
551 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
862 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  32.03 
 
 
853 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
408 aa  179  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  39.77 
 
 
1258 aa  179  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.98 
 
 
844 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 
819 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.09 
 
 
801 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
622 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  32.67 
 
 
622 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
560 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
671 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  37.79 
 
 
1258 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
622 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  33.43 
 
 
556 aa  169  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  41.27 
 
 
986 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0835  histidine kinase  35.13 
 
 
418 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.882013  normal  0.0872609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
970 aa  167  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
987 aa  167  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
402 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 
647 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3081  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
638 aa  164  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
713 aa  163  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.06 
 
 
1168 aa  163  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 
628 aa  163  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  37.74 
 
 
1379 aa  163  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.33 
 
 
842 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
872 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 
1262 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
552 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1990  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
677 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.871736  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  34.93 
 
 
1000 aa  160  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40 
 
 
1255 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 
640 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
498 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4196  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
680 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0175164 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  31.61 
 
 
801 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.07 
 
 
641 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.755089  normal  0.0153537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
514 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
642 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 
1509 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
701 aa  157  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.282736 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
552 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0039  histidine kinase  37.97 
 
 
655 aa  156  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  37.93 
 
 
516 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
812 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
803 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1102  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.2 
 
 
823 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813916  normal  0.354207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.55 
 
 
541 aa  154  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 
912 aa  154  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2564  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
559 aa  154  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382353  hitchhiker  0.0000221302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2807  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 
505 aa  154  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 
711 aa  154  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1250  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  28.82 
 
 
506 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.112207 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
548 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  40.4 
 
 
983 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  36.65 
 
 
548 aa  153  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 
553 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 
641 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
630 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0073  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
505 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
753 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  44.21 
 
 
506 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
503 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.534636  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
548 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2411  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.13 
 
 
497 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2731  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 
1007 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  40 
 
 
983 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.22 
 
 
952 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
408 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.397309  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  38.91 
 
 
560 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2844  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
550 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
1021 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
1146 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0558  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
763 aa  150  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.043921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  30.72 
 
 
1299 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  36.64 
 
 
410 aa  149  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  34.55 
 
 
1062 aa  149  9e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
1465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2537  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
1222 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  37.89 
 
 
737 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.1 
 
 
848 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 
654 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4423  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
678 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2249  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.57 
 
 
771 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>