More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4196 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4196  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
680 aa  1392    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0175164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.15 
 
 
1255 aa  204  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235161  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
1168 aa  189  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.8 
 
 
819 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.83 
 
 
819 aa  180  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.85 
 
 
804 aa  178  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  40.93 
 
 
853 aa  177  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 
844 aa  177  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
852 aa  173  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.49 
 
 
952 aa  169  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  39.15 
 
 
852 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  36.44 
 
 
1061 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 
842 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  38.12 
 
 
1092 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 
801 aa  165  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  35.22 
 
 
1062 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
714 aa  160  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
520 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
523 aa  158  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
495 aa  156  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
523 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
552 aa  153  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
862 aa  153  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
630 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
803 aa  151  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  37.9 
 
 
647 aa  150  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
402 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
592 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  36.29 
 
 
592 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  35.62 
 
 
1379 aa  147  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  35.59 
 
 
556 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  36.07 
 
 
395 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0696  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
570 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
701 aa  147  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.282736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  35.37 
 
 
516 aa  146  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
588 aa  145  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
522 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
560 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
654 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  35.16 
 
 
394 aa  144  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
407 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
552 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0672  histidine kinase  36.89 
 
 
373 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0672  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
373 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  36.67 
 
 
313 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
682 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.62 
 
 
1258 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
557 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  32.02 
 
 
801 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  34.98 
 
 
410 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
970 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  33.21 
 
 
912 aa  140  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2233  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
552 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0296242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  35.22 
 
 
542 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
516 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
695 aa  140  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0701  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
540 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
423 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0638  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
373 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
544 aa  139  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
394 aa  139  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1987  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
552 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
1262 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0558  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
763 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.043921  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 
753 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
641 aa  138  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
1309 aa  138  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
1247 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
662 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
507 aa  137  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2729  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
702 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.346218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  35.38 
 
 
630 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.06 
 
 
541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2828  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
584 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  37.61 
 
 
506 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
567 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
551 aa  135  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  33.48 
 
 
1258 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0878  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
840 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00403234  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  31.03 
 
 
737 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
1146 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
812 aa  134  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0247  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
407 aa  134  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.433647 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
515 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
760 aa  133  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2548  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
861 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
408 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  32.92 
 
 
591 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1866  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
649 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1990  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
677 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.871736  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
607 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
408 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.397309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
646 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 
1509 aa  132  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  32.45 
 
 
548 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  33.92 
 
 
673 aa  130  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  34.63 
 
 
611 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0763097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>