More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2598 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  54.19 
 
 		 731 aa  675    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 723 aa  1428    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  54.49 
 
 		 705 aa  664    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  39.57 
 
 		 720 aa  458  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  39.82 
 
 		 700 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  39.67 
 
 		 700 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  40.41 
 
 		 706 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  39.82 
 
 		 700 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  40.55 
 
 		 706 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  40.7 
 
 		 721 aa  442  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  40.55 
 
 		 706 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  39.67 
 
 		 700 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  39.67 
 
 		 700 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  39.67 
 
 		 700 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  39.67 
 
 		 700 aa  441  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  40.55 
 
 		 706 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  44.41 
 
 		 709 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  41.7 
 
 		 712 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  39.37 
 
 		 700 aa  436  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  39.37 
 
 		 700 aa  436  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  40.64 
 
 		 715 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  38.65 
 
 		 728 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  38.8 
 
 		 726 aa  425  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  43.43 
 
 		 697 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  39.26 
 
 		 681 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  39.14 
 
 		 742 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  40.78 
 
 		 706 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  40.47 
 
 		 710 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  38.26 
 
 		 694 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  39.37 
 
 		 743 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  40.91 
 
 		 736 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 		 706 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  36.99 
 
 		 701 aa  372  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  38.86 
 
 		 723 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 688 aa  300  7e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  35.4 
 
 		 691 aa  294  4e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  33.6 
 
 		 675 aa  282  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 705 aa  267  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 678 aa  266  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 680 aa  237  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 736 aa  150  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 734 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 770 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 681 aa  137  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 780 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 742 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 698 aa  133  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 681 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  24.06 
 
 		 701 aa  130  8.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 726 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  25.88 
 
 		 712 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 733 aa  126  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  25.79 
 
 		 727 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 706 aa  125  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 664 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 678 aa  122  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 715 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 737 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 717 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 700 aa  118  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 714 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 730 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 702 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 702 aa  111  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 713 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 769 aa  111  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  22.95 
 
 		 762 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 740 aa  108  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 716 aa  107  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 741 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  24.54 
 
 		 703 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 680 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 770 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 788 aa  100  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  21.37 
 
 		 696 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 682 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 801 aa  99  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  23.76 
 
 		 690 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 787 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 718 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 769 aa  95.1  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 720 aa  95.1  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 778 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 678 aa  94  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 690 aa  94  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  24.64 
 
 		 690 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 		 688 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 688 aa  92  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 700 aa  92  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  24.06 
 
 		 787 aa  91.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 786 aa  91.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 757 aa  91.3  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 873 aa  90.9  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 873 aa  90.5  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 760 aa  87.8  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 800 aa  87.4  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 739 aa  87  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 776 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 776 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  23.1 
 
 		 659 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>