269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_04883 on replicon BN001303
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  100 
 
 
816 aa  1683    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05480  DNA ligase, putative  40.48 
 
 
944 aa  491  1e-137  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  35.78 
 
 
803 aa  373  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  34.92 
 
 
664 aa  365  2e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  34.15 
 
 
932 aa  352  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  32.3 
 
 
719 aa  352  2e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  34.57 
 
 
651 aa  335  2e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  29.94 
 
 
601 aa  242  2e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  30.72 
 
 
583 aa  241  5e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  31.02 
 
 
584 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  30.76 
 
 
603 aa  236  9e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  30.58 
 
 
584 aa  233  1e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  30.45 
 
 
584 aa  229  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.89 
 
 
601 aa  228  4e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.32 
 
 
590 aa  224  4e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  28.5 
 
 
598 aa  213  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.71 
 
 
588 aa  212  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  27.62 
 
 
549 aa  183  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10585  predicted protein  32.81 
 
 
337 aa  181  4.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.81 
 
 
583 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.3 
 
 
552 aa  167  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  26.95 
 
 
567 aa  163  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  28.41 
 
 
568 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.76 
 
 
562 aa  158  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.33 
 
 
550 aa  155  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  25.33 
 
 
546 aa  154  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25 
 
 
573 aa  152  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.85 
 
 
556 aa  149  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.32 
 
 
553 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.46 
 
 
573 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  25.88 
 
 
513 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  26.61 
 
 
513 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  24.87 
 
 
547 aa  145  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.54 
 
 
531 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.19 
 
 
573 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.2 
 
 
592 aa  142  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25 
 
 
573 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.54 
 
 
582 aa  137  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.84 
 
 
510 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.8 
 
 
610 aa  135  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  27.17 
 
 
508 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  29.43 
 
 
509 aa  132  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.51 
 
 
548 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  28.46 
 
 
527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  27.88 
 
 
513 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.84 
 
 
509 aa  128  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  29.19 
 
 
503 aa  124  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.19 
 
 
522 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  28.85 
 
 
512 aa  121  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  24.31 
 
 
511 aa  118  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  25.37 
 
 
576 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  26.35 
 
 
534 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  27.58 
 
 
507 aa  115  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.79 
 
 
594 aa  114  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  28.74 
 
 
519 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  26.15 
 
 
520 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  26.15 
 
 
520 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  26.15 
 
 
520 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.09 
 
 
592 aa  111  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  25.89 
 
 
517 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  26.16 
 
 
507 aa  107  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.33 
 
 
539 aa  106  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.55 
 
 
506 aa  100  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.67 
 
 
1017 aa  98.2  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  28.79 
 
 
442 aa  97.4  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  26.59 
 
 
537 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  25.21 
 
 
495 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  27.53 
 
 
530 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  25.9 
 
 
797 aa  81.6  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  23.64 
 
 
877 aa  81.3  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00097  DNA ligase 4 (EC 6.5.1.1)(DNA ligase IV)(Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH83]  24.1 
 
 
1009 aa  79.7  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0295925  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  33.73 
 
 
871 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1305  DNA polymerase LigD ligase region  31.79 
 
 
343 aa  80.1  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  26.13 
 
 
436 aa  77.8  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  34.91 
 
 
872 aa  77  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  26.33 
 
 
758 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  26.73 
 
 
766 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  26 
 
 
758 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  26 
 
 
758 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  30.69 
 
 
896 aa  75.1  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  26.3 
 
 
763 aa  75.1  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  25.06 
 
 
584 aa  74.3  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  25 
 
 
535 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3103  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  29.74 
 
 
336 aa  72.8  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5557  DNA ligase (ATP)  29.06 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756283  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  24.65 
 
 
833 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  25.8 
 
 
847 aa  72  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  22.72 
 
 
532 aa  72.4  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20210  DNA polymerase LigD-like ligase domain-containing protein  28.74 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0459497  normal  0.30843 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  32.39 
 
 
954 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  25.36 
 
 
833 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  25.61 
 
 
831 aa  71.2  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  25.15 
 
 
533 aa  71.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  25.15 
 
 
533 aa  70.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  25.36 
 
 
833 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  25.73 
 
 
902 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3895  ATP-dependent DNA ligase  25.21 
 
 
551 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  24.67 
 
 
759 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5730  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  28.02 
 
 
350 aa  69.7  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996793  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  25.82 
 
 
855 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>