More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2694 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2694  putative substrate-binding protein  100 
 
 
414 aa  849    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2726  substrate-binding protein  71.5 
 
 
412 aa  632  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.913587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5073  putative substrate-binding protein  55.8 
 
 
410 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6432  extracellular ligand-binding receptor  51.8 
 
 
407 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00470186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3757  ABC transporter substrate-binding protein  48.18 
 
 
409 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0807  extracellular ligand-binding receptor  52.01 
 
 
402 aa  415  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4022  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 
404 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339015  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0659  putative substrate-binding protein  53.9 
 
 
412 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5024  extracellular ligand-binding receptor  50.24 
 
 
400 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.151241  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3229  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  53.05 
 
 
412 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1674  ABC transporter substrate-binding protein  47.93 
 
 
409 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2930  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  48.82 
 
 
411 aa  398  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1437  extracellular ligand-binding receptor  50.92 
 
 
401 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2526  ABC transporter substrate-binding protein  53 
 
 
411 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1336  extracellular ligand-binding receptor  50.77 
 
 
400 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1936  extracellular ligand-binding receptor  50.79 
 
 
409 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0141282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5530  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  50.52 
 
 
401 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3119  Extracellular ligand-binding receptor  50.52 
 
 
403 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.741733  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0057  extracellular ligand-binding receptor  50.52 
 
 
405 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3348  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 
403 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.164921 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2953  ABC transporter substrate-binding protein  51.75 
 
 
408 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137688  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1578  ABC transporter substrate-binding protein  49.15 
 
 
402 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3282  Extracellular ligand-binding receptor  50.66 
 
 
408 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0100489  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4450  Extracellular ligand-binding receptor  51.58 
 
 
401 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2450  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  48.45 
 
 
408 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.045034  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4449  Extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 
416 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29774  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3279  Extracellular ligand-binding receptor  50.78 
 
 
400 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2999  putative urea/short-chain binding protein of ABC transporter  47.93 
 
 
408 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0873398  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3244  extracellular ligand-binding receptor  51.84 
 
 
401 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114685  normal  0.545433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6461  Extracellular ligand-binding receptor  46.72 
 
 
402 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3779  putative ABC transporter, substrate binding protein  47.46 
 
 
408 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1339  ABC transporter substrate binding protein  50.26 
 
 
412 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.358784  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3503  putative ABC transporter, substrate binding protein  46.91 
 
 
408 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3789  Leu/Ile/Val-binding family protein  47.29 
 
 
409 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.710609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7057  Extracellular ligand-binding receptor  46.93 
 
 
420 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6250  ABC transporter substrate-binding protein  49.22 
 
 
413 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1790  Leu/Ile/Val-binding family protein  47.8 
 
 
417 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2079  branched chain amino acid transport system substrate binding protein  46.8 
 
 
404 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0709  Leu/Ile/Val-binding family protein  47.16 
 
 
406 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195015  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3615  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  46.29 
 
 
404 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.489489  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1152  UreA/short-chain amide ABC transporter  45.15 
 
 
415 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.471291  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3199  extracellular ligand-binding receptor  45.31 
 
 
405 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0731  hypothetical protein  46.88 
 
 
405 aa  360  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183807  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3421  ABC transporter substrate-binding protein  46.25 
 
 
406 aa  358  9e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2460  putative urea/short-chain binding protein of ABC transporter  46.95 
 
 
407 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.04538  normal  0.187515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2256  extracellular ligand-binding receptor  45.14 
 
 
403 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.777349  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1640  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  46.13 
 
 
412 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000640664  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2475  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  44.31 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2487  Extracellular ligand-binding receptor  44.94 
 
 
404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3887  ureA/short-chain amide ABC transporter  45.71 
 
 
413 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0891482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6215  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  46.06 
 
 
403 aa  355  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5091  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  45.03 
 
 
416 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339692  normal  0.603773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4079  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  47.77 
 
 
405 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23084  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4670  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.28 
 
 
403 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1254  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  44.62 
 
 
427 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1421  UreA/short-chain binding protein of ABC transporter  45.41 
 
 
403 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4400  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  47.24 
 
 
397 aa  349  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5117  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  49.48 
 
 
404 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4932  extracellular ligand-binding receptor  45.52 
 
 
409 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1377  ABC transporter substrate-binding protein  45.06 
 
 
404 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0969  UreA/short-chain binding protein of ABC transporter  45.41 
 
 
405 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0074  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  45.85 
 
 
399 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3593  putative ABC transporter substrate binding protein  45.08 
 
 
403 aa  347  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.636574 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3122  Extracellular ligand-binding receptor  46.53 
 
 
419 aa  344  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5957  extracellular ligand-binding receptor  42.96 
 
 
409 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4690  extracellular ligand-binding receptor  43.98 
 
 
397 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5300  putative periplasmic substrate binding protein  45.93 
 
 
397 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6729  Extracellular ligand-binding receptor  45.74 
 
 
401 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0894  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.85 
 
 
401 aa  342  9e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5823  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  45.74 
 
 
401 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281514  normal  0.102648 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0953  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  44.59 
 
 
401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0682  putative branched chain amino acid binding protein  44.62 
 
 
395 aa  338  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246685  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3303  amide-urea binding protein  43.24 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  43.55 
 
 
411 aa  336  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481667  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3023  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  48.05 
 
 
406 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1402  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid- binding protein  43.67 
 
 
401 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2864  putative periplasmic binding ABC transporter protein  43.62 
 
 
401 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1194  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  45.97 
 
 
405 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1298  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  44.76 
 
 
419 aa  332  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1717  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  43.41 
 
 
399 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620152  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1677  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand biinding protein  44.16 
 
 
404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0329  putative ABC transport protein substrate-binding component  44.85 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42175  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8044  Extracellular ligand-binding receptor  44.44 
 
 
406 aa  325  9e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3518  extracellular ligand-binding receptor  41.45 
 
 
402 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.36456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3211  Extracellular ligand-binding receptor  41.69 
 
 
402 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3297  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  42.75 
 
 
400 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3342  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  41.13 
 
 
402 aa  323  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4029  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  42.75 
 
 
400 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2137  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand biinding protein  43.41 
 
 
404 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0008  Extracellular ligand-binding receptor  41.01 
 
 
408 aa  322  5e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0278078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3369  extracellular ligand-binding receptor  42.53 
 
 
402 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0275  putative ureA/short-chain amide ABC transporter  44.62 
 
 
401 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1820  Extracellular ligand-binding receptor  43.41 
 
 
404 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7539  putative ABC transporter (substrate binding protein)  44.5 
 
 
394 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3537  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  41.44 
 
 
402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277166  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0182  extracellular ligand-binding receptor  42.23 
 
 
413 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0486  substrate-binding protein  43.31 
 
 
401 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1190  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  44.53 
 
 
401 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3913  Extracellular ligand-binding receptor  41.79 
 
 
404 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0019  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.54 
 
 
404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>