More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0659 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0659  putative substrate-binding protein  100 
 
 		 412 aa  839    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5073  putative substrate-binding protein  58.05 
 
 		 410 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3119  Extracellular ligand-binding receptor  57.94 
 
 		 403 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.741733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5530  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  55.39 
 
 		 401 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1936  extracellular ligand-binding receptor  57.37 
 
 		 409 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0141282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0057  extracellular ligand-binding receptor  54.75 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4022  extracellular ligand-binding receptor  57.66 
 
 		 404 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339015  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4450  Extracellular ligand-binding receptor  57.89 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6432  extracellular ligand-binding receptor  56.08 
 
 		 407 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00470186  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5024  extracellular ligand-binding receptor  56.33 
 
 		 400 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.151241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0807  extracellular ligand-binding receptor  56.36 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2526  ABC transporter substrate-binding protein  56.28 
 
 		 411 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3244  extracellular ligand-binding receptor  56.84 
 
 		 401 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114685  normal  0.545433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1336  extracellular ligand-binding receptor  55.18 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3279  Extracellular ligand-binding receptor  55.94 
 
 		 400 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4449  Extracellular ligand-binding receptor  55.15 
 
 		 416 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1578  ABC transporter substrate-binding protein  55.73 
 
 		 402 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3348  extracellular ligand-binding receptor  55.79 
 
 		 403 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.164921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2694  putative substrate-binding protein  53.9 
 
 		 414 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1674  ABC transporter substrate-binding protein  52.09 
 
 		 409 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7057  Extracellular ligand-binding receptor  51.81 
 
 		 420 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1437  extracellular ligand-binding receptor  52.81 
 
 		 401 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.694305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3757  ABC transporter substrate-binding protein  50.77 
 
 		 409 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6215  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  51.45 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6250  ABC transporter substrate-binding protein  54.47 
 
 		 413 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1790  Leu/Ile/Val-binding family protein  52.89 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3282  Extracellular ligand-binding receptor  51.72 
 
 		 408 aa  411  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0100489  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3789  Leu/Ile/Val-binding family protein  51.71 
 
 		 409 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.710609 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1377  ABC transporter substrate-binding protein  52.32 
 
 		 404 aa  411  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3229  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  53.63 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2726  substrate-binding protein  50.98 
 
 		 412 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.913587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1339  ABC transporter substrate binding protein  51.98 
 
 		 412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.358784  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0709  Leu/Ile/Val-binding family protein  51.58 
 
 		 406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195015  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6461  Extracellular ligand-binding receptor  51.53 
 
 		 402 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1640  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  52.37 
 
 		 412 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000640664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0074  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  50.38 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4079  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  49.48 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3887  ureA/short-chain amide ABC transporter  50.53 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0891482  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2930  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  48.54 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3122  Extracellular ligand-binding receptor  52.23 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4400  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  50.78 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0682  putative branched chain amino acid binding protein  49.62 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246685  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3593  putative ABC transporter substrate binding protein  49.21 
 
 		 403 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.636574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1298  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  51.31 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6729  Extracellular ligand-binding receptor  50.25 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5823  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  50.25 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281514  normal  0.102648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3199  extracellular ligand-binding receptor  47.24 
 
 		 405 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3779  putative ABC transporter, substrate binding protein  49.1 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2256  extracellular ligand-binding receptor  46.84 
 
 		 403 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.777349  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2487  Extracellular ligand-binding receptor  46.98 
 
 		 404 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3421  ABC transporter substrate-binding protein  49.61 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2450  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  49.23 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.045034  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4690  extracellular ligand-binding receptor  48.37 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0329  putative ABC transport protein substrate-binding component  48.72 
 
 		 405 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5300  putative periplasmic substrate binding protein  49.74 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3503  putative ABC transporter, substrate binding protein  48.85 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0953  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  48.95 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2864  putative periplasmic binding ABC transporter protein  47.16 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3023  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  54.09 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0894  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.21 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3303  amide-urea binding protein  49.48 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2953  ABC transporter substrate-binding protein  52.06 
 
 		 408 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0969  UreA/short-chain binding protein of ABC transporter  49.61 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2999  putative urea/short-chain binding protein of ABC transporter  48.19 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0873398  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  49.87 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481667  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1421  UreA/short-chain binding protein of ABC transporter  49.09 
 
 		 403 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5117  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  52.51 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3615  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  48.69 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.489489  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2079  branched chain amino acid transport system substrate binding protein  49.21 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4670  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.63 
 
 		 403 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0008  Extracellular ligand-binding receptor  45.63 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5091  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  45.93 
 
 		 416 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339692  normal  0.603773 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1677  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand biinding protein  49.6 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1402  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid- binding protein  48.28 
 
 		 401 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3297  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  48.29 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300791  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2137  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand biinding protein  48.81 
 
 		 404 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4029  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  48.29 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1820  Extracellular ligand-binding receptor  48.81 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0486  substrate-binding protein  48.16 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1254  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  47.15 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1152  UreA/short-chain amide ABC transporter  46.51 
 
 		 415 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.471291  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2475  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  44.96 
 
 		 405 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0275  putative ureA/short-chain amide ABC transporter  47.89 
 
 		 401 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1194  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  48.83 
 
 		 405 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4932  extracellular ligand-binding receptor  47.63 
 
 		 409 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3849  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  52.39 
 
 		 392 aa  361  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3292  hypothetical protein  46.98 
 
 		 400 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.406168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0554  ureA/short-chain amide ABC transporter  46.6 
 
 		 402 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.930825  normal  0.0786148 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1717  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  44.96 
 
 		 399 aa  355  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7539  putative ABC transporter (substrate binding protein)  48.16 
 
 		 394 aa  355  6.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0182  extracellular ligand-binding receptor  46.32 
 
 		 413 aa  355  7.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0731  hypothetical protein  47.39 
 
 		 405 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2460  putative urea/short-chain binding protein of ABC transporter  47.69 
 
 		 407 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.04538  normal  0.187515 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5957  extracellular ligand-binding receptor  44.74 
 
 		 409 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1850  putative ABC transporter, substrate binding protein  45.22 
 
 		 402 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3342  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  44.19 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3369  extracellular ligand-binding receptor  45.34 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3877  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  44.94 
 
 		 406 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1473  putative urea/short-chain binding protein of ABC transporter  46.17 
 
 		 406 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3211  Extracellular ligand-binding receptor  43.93 
 
 		 402 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>