More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0221 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 900 aa  657    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 926 aa  639    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 923 aa  662    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 914 aa  668    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 915 aa  665    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 916 aa  660    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 913 aa  685    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 923 aa  678    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 892 aa  769    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 892 aa  727    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 896 aa  760    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 913 aa  641    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 899 aa  775    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 913 aa  680    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 907 aa  1849    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 892 aa  732    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 904 aa  634  1e-180  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 924 aa  629  1e-179  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 892 aa  629  1e-179  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 892 aa  626  1e-178  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 910 aa  625  1e-177  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 892 aa  622  1e-177  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 892 aa  623  1e-177  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 882 aa  617  1e-175  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 926 aa  617  1e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 925 aa  613  9.999999999999999e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 926 aa  611  1e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 889 aa  503  1e-141  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 865 aa  325  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 		 870 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 863 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 		 876 aa  317  6e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 		 876 aa  313  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 880 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 		 863 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 		 878 aa  309  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 879 aa  304  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 877 aa  303  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 		 876 aa  301  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 859 aa  301  4e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 876 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 878 aa  298  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 875 aa  296  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 875 aa  291  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 878 aa  291  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0936  alanyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 		 870 aa  290  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 882 aa  289  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  27.77 
 
 		 876 aa  289  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 		 863 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2405  alanyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 901 aa  288  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.665825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 874 aa  287  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 885 aa  287  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 892 aa  287  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 		 865 aa  286  8e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 		 865 aa  286  8e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 876 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 884 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1023  alanyl-tRNA synthetase  28.59 
 
 		 865 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 878 aa  286  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3738  alanyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 		 875 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 883 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 874 aa  286  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 		 860 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 		 874 aa  285  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 874 aa  285  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 		 880 aa  284  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2104  alanyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 883 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653271  normal  0.762887 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 		 881 aa  283  9e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 869 aa  283  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 880 aa  282  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 897 aa  282  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0451  alanyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 		 883 aa  281  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 		 879 aa  281  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 		 880 aa  281  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 		 886 aa  281  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 897 aa  280  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 		 874 aa  280  8e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 885 aa  280  9e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 874 aa  280  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 874 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 		 874 aa  280  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  26.23 
 
 		 865 aa  278  2e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 		 882 aa  279  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 876 aa  278  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 		 874 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 		 874 aa  278  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 874 aa  277  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 874 aa  277  8e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3633  alanyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 875 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511669  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  25.11 
 
 		 856 aa  276  1.0000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  28.59 
 
 		 872 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 		 889 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 886 aa  276  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 		 891 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 874 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 879 aa  275  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 		 874 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 		 860 aa  274  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 874 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 		 878 aa  274  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>