More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1313 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
900 aa  1839    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
892 aa  672    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 
899 aa  655    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
892 aa  659    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
914 aa  649    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
892 aa  671    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
892 aa  672    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
910 aa  677    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
924 aa  638    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
892 aa  717    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
913 aa  660    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  62.1 
 
 
904 aa  1143    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
892 aa  688    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
896 aa  691    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
892 aa  698    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
907 aa  634  1e-180  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
882 aa  630  1e-179  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
915 aa  626  1e-178  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
923 aa  622  1e-177  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
913 aa  624  1e-177  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
926 aa  620  1e-176  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
926 aa  616  1e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
923 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
916 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
926 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
925 aa  594  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
913 aa  589  1e-167  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
889 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 
876 aa  305  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 
876 aa  294  4e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 
879 aa  281  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 
880 aa  281  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  28.56 
 
 
863 aa  280  7e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 
877 aa  278  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 
863 aa  278  4e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 
883 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2201  alanyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 
885 aa  276  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 
889 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
876 aa  273  8.000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 
880 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 
878 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 
887 aa  267  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 
879 aa  267  8e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 
878 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  25.64 
 
 
885 aa  266  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
878 aa  265  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 
870 aa  264  6e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 
897 aa  262  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 
884 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 
897 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 
874 aa  261  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 
856 aa  261  6e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  25.74 
 
 
865 aa  260  6e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 
875 aa  259  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 
881 aa  259  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
874 aa  260  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 
897 aa  260  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
874 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 
865 aa  258  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  29 
 
 
874 aa  258  5e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 
874 aa  258  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  25.36 
 
 
869 aa  257  6e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 
876 aa  257  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  26.21 
 
 
896 aa  256  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1957  alanyl-tRNA synthetase  25.86 
 
 
884 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103878  normal  0.2106 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00511  alanyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 
890 aa  256  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.409533  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 
874 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1642  alanyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 
887 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.338529  hitchhiker  0.000000000232232 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1023  alanyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 
865 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  25.41 
 
 
874 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 
899 aa  255  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 
874 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 
886 aa  255  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 
886 aa  254  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0898  alanyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 
881 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2557  alanyl-tRNA synthetase  25.35 
 
 
887 aa  254  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243689  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 
891 aa  254  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5505  alanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 
886 aa  254  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195836  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 
900 aa  254  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 
886 aa  253  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  25.69 
 
 
860 aa  253  9.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1164  alanyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
885 aa  253  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.855181  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  25.36 
 
 
874 aa  253  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 
879 aa  253  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
879 aa  253  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  25.52 
 
 
878 aa  252  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 
879 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 
878 aa  252  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  28 
 
 
867 aa  252  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  26.21 
 
 
874 aa  251  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 
897 aa  251  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 
874 aa  251  6e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 
885 aa  250  8e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0728  alanyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 
886 aa  250  9e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.846267  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 
891 aa  250  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4372  alanyl-tRNA synthetase  25.96 
 
 
889 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1987  alanyl-tRNA synthetase  25.98 
 
 
885 aa  249  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363624  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2821  alanyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 
891 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29967  normal  0.126573 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 
864 aa  248  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  25.47 
 
 
874 aa  248  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>