More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0513 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 900 aa  672    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 913 aa  724    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 915 aa  702    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 904 aa  636    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 926 aa  741    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  82.29 
 
 		 892 aa  1537    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 923 aa  777    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 914 aa  731    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 892 aa  654    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 925 aa  711    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 892 aa  699    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  96.97 
 
 		 892 aa  1766    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  96.41 
 
 		 892 aa  1755    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 896 aa  666    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 916 aa  733    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 924 aa  715    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 926 aa  730    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 926 aa  723    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 923 aa  788    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 899 aa  661    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 892 aa  1834    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 913 aa  746    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  68.65 
 
 		 910 aa  1307    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 913 aa  754    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 882 aa  690    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 892 aa  670    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 907 aa  601  1e-170  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 889 aa  533  1e-150  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  27 
 
 		 876 aa  280  9e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 876 aa  274  6e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  27.79 
 
 		 870 aa  273  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 		 865 aa  272  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 867 aa  272  2.9999999999999997e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 863 aa  270  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 863 aa  268  5e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 		 859 aa  267  5.999999999999999e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  26.16 
 
 		 892 aa  266  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 865 aa  263  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 878 aa  262  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 		 863 aa  263  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  26.54 
 
 		 878 aa  261  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 874 aa  258  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 		 869 aa  257  6e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 875 aa  257  7e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 864 aa  257  8e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 		 872 aa  256  1.0000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 		 876 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 876 aa  255  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 876 aa  255  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 876 aa  255  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 		 903 aa  254  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 876 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 878 aa  254  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 876 aa  254  6e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  26.32 
 
 		 876 aa  254  6e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 876 aa  254  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 874 aa  253  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 		 884 aa  253  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  26.21 
 
 		 876 aa  253  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  25.11 
 
 		 860 aa  252  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 876 aa  252  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 882 aa  252  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 876 aa  252  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 878 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 		 879 aa  251  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 876 aa  251  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07800  alanyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 		 889 aa  251  6e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0367295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 		 875 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 		 874 aa  249  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 876 aa  249  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  26.21 
 
 		 876 aa  248  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  24.97 
 
 		 860 aa  248  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 		 886 aa  248  3e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 874 aa  248  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  26.21 
 
 		 876 aa  248  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  25.88 
 
 		 876 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 		 886 aa  248  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1957  alanyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 		 884 aa  248  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103878  normal  0.2106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 		 874 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 		 876 aa  247  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  25.96 
 
 		 874 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 867 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  26.02 
 
 		 874 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 		 878 aa  246  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 876 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  25.86 
 
 		 865 aa  246  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  24.51 
 
 		 875 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 		 876 aa  246  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 		 874 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 876 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 880 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 874 aa  245  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 		 881 aa  245  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 		 877 aa  245  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  25.53 
 
 		 874 aa  245  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 		 900 aa  245  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  24.73 
 
 		 876 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 886 aa  244  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3738  alanyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 		 875 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 883 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>