More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1447 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
900 aa  654    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
924 aa  750    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
926 aa  742    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
882 aa  1813    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
896 aa  691    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 
923 aa  762    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
892 aa  707    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
892 aa  677    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
913 aa  767    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
892 aa  711    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
899 aa  668    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
892 aa  681    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 
916 aa  753    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
915 aa  758    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
926 aa  748    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
923 aa  750    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
926 aa  734    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
892 aa  693    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
914 aa  759    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
910 aa  722    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
925 aa  729    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
913 aa  782    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
892 aa  707    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  44 
 
 
913 aa  728    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
892 aa  674    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
904 aa  634  1e-180  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
907 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 
889 aa  486  1e-135  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 
884 aa  260  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 
876 aa  259  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 
874 aa  260  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
863 aa  258  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 
863 aa  258  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 
860 aa  257  6e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 
860 aa  256  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  26.41 
 
 
863 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1957  alanyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 
884 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103878  normal  0.2106 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 
879 aa  253  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  27.14 
 
 
876 aa  253  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 
879 aa  253  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 
880 aa  252  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  25.92 
 
 
877 aa  248  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 
883 aa  248  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2557  alanyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 
887 aa  248  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243689  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
886 aa  247  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 
886 aa  247  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  26.13 
 
 
878 aa  247  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
886 aa  247  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 
859 aa  244  6e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  26.13 
 
 
887 aa  243  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2405  alanyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 
901 aa  243  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.665825  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  26.03 
 
 
874 aa  243  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 
875 aa  243  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 
876 aa  243  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 
874 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 
874 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 
874 aa  240  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  26.13 
 
 
878 aa  240  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 
874 aa  240  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  25.84 
 
 
874 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 
874 aa  240  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 
874 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  25.27 
 
 
897 aa  239  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 
874 aa  238  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1266  alanyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 
909 aa  238  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 
900 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 
869 aa  237  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  24.54 
 
 
892 aa  237  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  25.7 
 
 
879 aa  236  9e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 
874 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 
884 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 
874 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 
865 aa  235  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 
897 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 
876 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 
865 aa  235  3e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  24.32 
 
 
865 aa  235  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  26.41 
 
 
874 aa  234  5e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 
880 aa  234  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 
877 aa  234  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 
877 aa  234  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  25.44 
 
 
874 aa  234  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 
897 aa  234  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  25.22 
 
 
897 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 
875 aa  233  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  26.02 
 
 
896 aa  233  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 
874 aa  232  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 
874 aa  232  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3523  alanyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 
895 aa  232  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0021732 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 
864 aa  232  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  26.21 
 
 
889 aa  232  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 
872 aa  231  3e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 
891 aa  231  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 
882 aa  231  5e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  26.08 
 
 
880 aa  231  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  24.84 
 
 
875 aa  230  8e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  24.1 
 
 
860 aa  230  9e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 
867 aa  230  9e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  25.03 
 
 
874 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 
870 aa  230  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>