More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0039 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 892 aa  656    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 914 aa  1278    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 882 aa  731    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  62.45 
 
 		 915 aa  1203    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 892 aa  734    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 892 aa  733    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 923 aa  993    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  64 
 
 		 913 aa  1261    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 925 aa  842    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 910 aa  745    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 926 aa  887    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 916 aa  1895    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 899 aa  654    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 923 aa  987    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 924 aa  831    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 926 aa  833    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 892 aa  726    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 892 aa  732    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 896 aa  664    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 926 aa  834    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  61.53 
 
 		 913 aa  1186    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 913 aa  974    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 892 aa  653    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 892 aa  635  1e-180  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 907 aa  627  1e-178  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 900 aa  597  1e-169  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  38.47 
 
 		 904 aa  580  1e-164  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 889 aa  504  1e-141  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 		 879 aa  279  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  25.98 
 
 		 870 aa  276  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 		 876 aa  271  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  24.12 
 
 		 878 aa  270  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 		 874 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 880 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  27.47 
 
 		 874 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 		 877 aa  266  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 		 883 aa  265  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 874 aa  263  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 		 879 aa  261  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 876 aa  261  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 874 aa  260  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 878 aa  259  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 892 aa  257  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 876 aa  257  8e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 876 aa  257  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  24.63 
 
 		 865 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 876 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 876 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 876 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 874 aa  255  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 863 aa  255  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 876 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 876 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  25.99 
 
 		 876 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  26.1 
 
 		 876 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  26 
 
 		 875 aa  254  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 876 aa  254  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 876 aa  254  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 876 aa  254  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 876 aa  254  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 876 aa  254  7e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 874 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 876 aa  253  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 875 aa  253  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  25.24 
 
 		 879 aa  253  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 892 aa  252  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  25.99 
 
 		 876 aa  252  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 875 aa  253  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 900 aa  251  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 874 aa  251  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 		 874 aa  251  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 874 aa  251  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 867 aa  251  6e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  25.53 
 
 		 892 aa  250  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 874 aa  250  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  25.64 
 
 		 874 aa  250  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 		 897 aa  249  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 		 869 aa  249  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  25.99 
 
 		 872 aa  248  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 884 aa  248  4e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  25.27 
 
 		 865 aa  248  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 886 aa  248  4e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  25.53 
 
 		 874 aa  248  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 868 aa  247  6e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  26.72 
 
 		 878 aa  247  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 		 874 aa  247  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 		 880 aa  247  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 		 891 aa  247  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 		 874 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 		 886 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  25.05 
 
 		 874 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  25.21 
 
 		 875 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  26.16 
 
 		 880 aa  246  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  26.39 
 
 		 874 aa  245  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 		 886 aa  245  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 		 897 aa  245  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 		 856 aa  244  3.9999999999999997e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 		 874 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  25.97 
 
 		 874 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 875 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>