More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1380 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 910 aa  761    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 892 aa  726    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 926 aa  821    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 892 aa  727    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 926 aa  799    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  59.91 
 
 		 913 aa  1216    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 913 aa  1894    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 923 aa  948    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  62.26 
 
 		 915 aa  1174    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 896 aa  643    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 892 aa  717    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  61.53 
 
 		 916 aa  1204    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 924 aa  785    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 925 aa  795    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 		 923 aa  949    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 892 aa  715    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 882 aa  723    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 		 914 aa  1189    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 913 aa  925    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 926 aa  813    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 892 aa  632  1e-180  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 907 aa  623  1e-177  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 892 aa  623  1e-177  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 899 aa  610  1e-173  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 892 aa  595  1e-168  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 900 aa  590  1e-167  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 904 aa  568  1e-160  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 889 aa  473  1.0000000000000001e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  25.96 
 
 		 877 aa  271  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  25.05 
 
 		 863 aa  270  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  25.37 
 
 		 863 aa  269  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 		 870 aa  267  7e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 		 876 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 		 880 aa  263  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 		 878 aa  261  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 863 aa  261  5.0000000000000005e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 		 879 aa  259  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 		 874 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 869 aa  258  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 876 aa  258  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 		 879 aa  257  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 		 865 aa  257  7e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  26.02 
 
 		 897 aa  257  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 		 897 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 		 874 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 		 875 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 		 892 aa  256  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  26.66 
 
 		 878 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 865 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 		 897 aa  255  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  25.7 
 
 		 874 aa  255  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  26.81 
 
 		 878 aa  255  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 883 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 875 aa  254  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 		 878 aa  254  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 876 aa  254  7e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 884 aa  253  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 		 876 aa  252  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 		 886 aa  252  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 		 874 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  25.37 
 
 		 886 aa  251  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 		 886 aa  251  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 		 874 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 		 905 aa  249  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 875 aa  248  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 876 aa  248  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 905 aa  248  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 		 860 aa  248  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  25.24 
 
 		 874 aa  248  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  25.82 
 
 		 886 aa  247  9e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 		 876 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  25.69 
 
 		 876 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 889 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 876 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 876 aa  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 		 879 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 876 aa  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 879 aa  246  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 879 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 885 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 876 aa  245  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1614  alanyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 869 aa  245  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 874 aa  245  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 876 aa  245  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 		 876 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 876 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 860 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 		 876 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 880 aa  244  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  25.44 
 
 		 865 aa  244  7e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  25.69 
 
 		 874 aa  244  7e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 		 876 aa  244  7.999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 864 aa  244  7.999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 876 aa  243  9e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 		 865 aa  243  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  25.89 
 
 		 876 aa  243  9e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  26.19 
 
 		 874 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  25.44 
 
 		 865 aa  243  1e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 905 aa  243  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 		 876 aa  243  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>