More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_00511 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 876 aa  655    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 876 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1268  alanyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 876 aa  661    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 875 aa  667    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 874 aa  647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 876 aa  656    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 867 aa  675    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 880 aa  679    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 884 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  74.49 
 
 		 886 aa  1385    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 876 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28371  alanyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 930 aa  991    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.578023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 874 aa  678    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 889 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 874 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1719  alanyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 874 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 880 aa  967    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 874 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 874 aa  670    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 860 aa  682    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 860 aa  686    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00511  alanyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 890 aa  999    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.409533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 874 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 863 aa  646    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 889 aa  648    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1377  alanyl-tRNA synthetase  60.78 
 
 		 886 aa  1048    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 874 aa  694    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 886 aa  645    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 874 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 880 aa  945    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 874 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  41.25 
 
 		 873 aa  681    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 903 aa  660    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 874 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 882 aa  669    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 897 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2173  alanyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 899 aa  1001    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2518  alanyl-tRNA synthetase  55.47 
 
 		 889 aa  959    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 876 aa  681    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 880 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 864 aa  695    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 875 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  74.27 
 
 		 886 aa  1382    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 		 899 aa  933    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 862 aa  673    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 875 aa  646    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 881 aa  686    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 874 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 859 aa  639    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 874 aa  664    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00581  alanyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 886 aa  1023    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 874 aa  636    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 931 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 876 aa  649    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 876 aa  660    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  51.65 
 
 		 906 aa  876    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 874 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 878 aa  638    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 874 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 874 aa  643    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 874 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 868 aa  661    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0047  alanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 871 aa  642    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.620417  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 890 aa  645    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 884 aa  700    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 874 aa  673    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 892 aa  671    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 872 aa  651    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 874 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 897 aa  687    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 865 aa  677    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1266  alanyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 909 aa  645    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  74.38 
 
 		 886 aa  1385    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 863 aa  726    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 872 aa  661    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 874 aa  705    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 874 aa  950    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 905 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1987  alanyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 885 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363624  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 869 aa  677    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 865 aa  643    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 880 aa  646    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 860 aa  664    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 874 aa  694    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 874 aa  661    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 886 aa  1805    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 874 aa  651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 897 aa  689    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 885 aa  657    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 878 aa  648    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 876 aa  656    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 879 aa  675    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 887 aa  653    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 878 aa  688    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 878 aa  675    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 885 aa  645    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 876 aa  674    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 892 aa  652    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 876 aa  651    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 879 aa  662    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>