More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1898 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 900 aa  658    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 892 aa  676    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 913 aa  675    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 914 aa  663    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 915 aa  654    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 923 aa  653    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  58.8 
 
 		 896 aa  1051    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 892 aa  661    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 899 aa  1836    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 892 aa  1034    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 916 aa  669    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 923 aa  664    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 892 aa  671    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 892 aa  666    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 910 aa  663    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 904 aa  642    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 913 aa  665    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  57.3 
 
 		 892 aa  1009    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 907 aa  753    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 892 aa  1005    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 882 aa  652    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 924 aa  626  1e-178  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 926 aa  622  1e-176  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 926 aa  621  1e-176  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 913 aa  609  1e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 926 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 925 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 889 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 876 aa  288  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 880 aa  273  8.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 		 870 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 877 aa  271  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  26.13 
 
 		 883 aa  269  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 		 875 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 891 aa  265  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 878 aa  265  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 		 872 aa  264  4.999999999999999e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 890 aa  263  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 		 876 aa  262  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 		 879 aa  262  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 884 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1266  alanyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 909 aa  261  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 897 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1957  alanyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 884 aa  258  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103878  normal  0.2106 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 		 874 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  26.24 
 
 		 865 aa  256  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 		 897 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 887 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 891 aa  255  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 897 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0936  alanyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 		 870 aa  254  5.000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 896 aa  254  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 897 aa  254  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1987  alanyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 885 aa  254  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363624  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 863 aa  254  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 		 868 aa  254  7e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1164  alanyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 885 aa  254  7e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.855181  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 874 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 		 885 aa  253  9.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 		 878 aa  252  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 874 aa  252  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  26.23 
 
 		 874 aa  252  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 874 aa  252  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 		 874 aa  251  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0156  alanyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 		 848 aa  251  3e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 878 aa  251  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 		 892 aa  251  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 874 aa  251  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0951  alanyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 		 854 aa  250  8e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.197115  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 882 aa  249  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 		 865 aa  249  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2579  alanyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 		 913 aa  249  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159446  normal  0.328441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4372  alanyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 889 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 		 891 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 		 885 aa  248  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2557  alanyl-tRNA synthetase  25.97 
 
 		 887 aa  248  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243689  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0457  alanyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 		 881 aa  247  6e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 		 874 aa  247  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 874 aa  247  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 		 856 aa  246  9e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 892 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0728  alanyl-tRNA synthetase  26.08 
 
 		 886 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.846267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 890 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 		 874 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 877 aa  245  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 		 884 aa  245  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1642  alanyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 887 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.338529  hitchhiker  0.000000000232232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 		 905 aa  244  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 867 aa  244  6e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 		 879 aa  244  6e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 892 aa  244  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 880 aa  244  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  25.3 
 
 		 879 aa  243  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  25.44 
 
 		 860 aa  243  9e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  25.44 
 
 		 860 aa  243  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  25.64 
 
 		 874 aa  243  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 875 aa  243  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 		 869 aa  243  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 874 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  25.23 
 
 		 867 aa  243  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>