More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2228 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 892 aa  689    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 900 aa  707    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 892 aa  1810    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  81.37 
 
 		 896 aa  1487    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  82.29 
 
 		 892 aa  1501    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 892 aa  688    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 915 aa  656    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 923 aa  642    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 913 aa  646    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 914 aa  653    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 910 aa  692    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 916 aa  656    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 892 aa  692    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 892 aa  693    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 882 aa  656    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 923 aa  665    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 926 aa  637    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 904 aa  666    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 913 aa  656    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 899 aa  1022    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 907 aa  739    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  81.95 
 
 		 892 aa  1511    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 924 aa  634  1e-180  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 926 aa  631  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 925 aa  626  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 913 aa  626  1e-178  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 926 aa  619  1e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 889 aa  531  1e-149  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 880 aa  304  6.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 		 878 aa  290  8e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 		 876 aa  286  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 879 aa  281  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 870 aa  281  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 		 879 aa  281  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 		 879 aa  280  9e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 		 883 aa  277  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 877 aa  277  6e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 878 aa  275  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 878 aa  271  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 		 885 aa  270  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 878 aa  269  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 		 897 aa  269  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 		 879 aa  268  4e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 		 875 aa  268  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 897 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 874 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 		 865 aa  267  7e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2405  alanyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 901 aa  266  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.665825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  27.58 
 
 		 865 aa  265  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 		 874 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 874 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 876 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  27.79 
 
 		 876 aa  265  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 879 aa  265  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3523  alanyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 		 895 aa  265  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0021732 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 		 863 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 		 874 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 897 aa  264  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 		 897 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 880 aa  263  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0936  alanyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 870 aa  262  2e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 882 aa  263  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 902 aa  261  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 		 869 aa  261  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 874 aa  261  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5834  alanyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 886 aa  261  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 897 aa  261  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 880 aa  261  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 		 865 aa  261  5.0000000000000005e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  26.08 
 
 		 865 aa  261  6e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  26.48 
 
 		 874 aa  261  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 874 aa  259  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 		 875 aa  259  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 874 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 		 872 aa  258  4e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 885 aa  258  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5505  alanyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 		 886 aa  257  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195836  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 891 aa  258  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  28.96 
 
 		 881 aa  257  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 891 aa  258  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 905 aa  257  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  26.66 
 
 		 863 aa  257  7e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 878 aa  257  7e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2372  alanyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 		 883 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726035  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 		 884 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 867 aa  256  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 874 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 874 aa  255  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  24.5 
 
 		 860 aa  255  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 		 859 aa  255  3e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 891 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 896 aa  254  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  26.02 
 
 		 876 aa  254  5.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 878 aa  254  5.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  26.08 
 
 		 874 aa  254  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 874 aa  254  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 874 aa  254  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 874 aa  254  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 874 aa  254  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0877  alanyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 879 aa  254  6e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.438968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>