More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1124 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 900 aa  639    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 914 aa  803    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 913 aa  821    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 892 aa  729    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 892 aa  640    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 892 aa  713    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 923 aa  849    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 913 aa  785    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  73.92 
 
 		 926 aa  1377    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  75.03 
 
 		 926 aa  1390    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 892 aa  711    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 896 aa  640    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 916 aa  846    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 915 aa  797    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  74.54 
 
 		 925 aa  1365    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 923 aa  856    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 924 aa  1876    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  70.51 
 
 		 926 aa  1269    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 892 aa  710    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 910 aa  714    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 913 aa  809    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 882 aa  736    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 892 aa  629  1e-179  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 899 aa  626  1e-178  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 904 aa  629  1e-178  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 892 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 907 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 		 889 aa  512  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 		 878 aa  301  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 		 879 aa  291  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 879 aa  290  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 880 aa  286  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 877 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 876 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 886 aa  283  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 		 886 aa  282  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 869 aa  282  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 		 876 aa  279  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 		 886 aa  278  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 		 863 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0936  alanyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 870 aa  275  3e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 904 aa  274  7e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 		 892 aa  273  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 889 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 		 876 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 		 905 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 883 aa  271  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 		 905 aa  271  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 878 aa  270  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 865 aa  270  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  27.47 
 
 		 864 aa  270  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  25.73 
 
 		 876 aa  270  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  25.74 
 
 		 863 aa  269  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 		 880 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 880 aa  265  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 		 879 aa  266  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 		 879 aa  266  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 870 aa  266  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  30 
 
 		 906 aa  265  3e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 		 905 aa  265  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 		 865 aa  265  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 863 aa  265  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1614  alanyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 869 aa  263  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 		 876 aa  262  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 		 859 aa  262  3e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  24.79 
 
 		 865 aa  261  3e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 885 aa  261  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 		 892 aa  261  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 		 876 aa  260  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 874 aa  260  7e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 878 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 882 aa  259  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 856 aa  259  2e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 874 aa  259  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 		 878 aa  259  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 876 aa  258  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 868 aa  258  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 		 882 aa  257  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 		 867 aa  255  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 867 aa  255  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 875 aa  254  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  26.24 
 
 		 878 aa  253  8.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0728  alanyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 886 aa  253  9.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.846267  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  26.13 
 
 		 875 aa  253  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 876 aa  253  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 892 aa  253  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 		 876 aa  252  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  27.99 
 
 		 875 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1164  alanyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 885 aa  252  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.855181  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3176  alanyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 874 aa  253  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 		 876 aa  252  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 876 aa  252  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 		 876 aa  252  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  26.65 
 
 		 876 aa  252  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 876 aa  252  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00511  alanyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 890 aa  252  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.409533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 879 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 874 aa  251  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0101  alanyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 884 aa  251  5e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 		 886 aa  251  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>