More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0919 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
900 aa  705    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
892 aa  683    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
926 aa  652    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
914 aa  652    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
892 aa  675    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
892 aa  672    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
923 aa  639    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  88.23 
 
 
892 aa  1595    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
916 aa  667    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
915 aa  662    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
923 aa  678    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
924 aa  640    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 
899 aa  1019    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
913 aa  652    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
910 aa  690    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
882 aa  664    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
892 aa  674    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
913 aa  668    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  81.95 
 
 
892 aa  1548    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
926 aa  641    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
904 aa  687    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
907 aa  720    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  81.03 
 
 
896 aa  1485    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
892 aa  1816    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
925 aa  633  1e-180  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
913 aa  628  1e-178  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
926 aa  624  1e-177  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
889 aa  536  1e-151  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 
878 aa  291  5.0000000000000004e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 
880 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 
877 aa  285  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 
878 aa  280  8e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  29 
 
 
879 aa  278  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  29 
 
 
879 aa  277  7e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 
870 aa  276  9e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 
878 aa  272  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 
878 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 
876 aa  267  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 
883 aa  266  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 
879 aa  265  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  26.48 
 
 
863 aa  262  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
881 aa  262  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0936  alanyl-tRNA synthetase  27.55 
 
 
870 aa  261  4e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 
874 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 
863 aa  260  7e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
876 aa  260  9e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  26.41 
 
 
865 aa  260  1e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
891 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 
879 aa  259  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 
874 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 
876 aa  258  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
882 aa  258  4e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  26.66 
 
 
875 aa  257  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 
897 aa  257  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 
874 aa  257  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2405  alanyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 
901 aa  256  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.665825  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 
859 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  26.39 
 
 
897 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 
885 aa  255  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 
874 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 
874 aa  255  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 
896 aa  255  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 
874 aa  255  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  26.39 
 
 
874 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 
880 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 
897 aa  254  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 
878 aa  254  7e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 
869 aa  253  9.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0728  alanyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 
886 aa  253  9.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.846267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 
879 aa  253  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  27.99 
 
 
891 aa  253  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1987  alanyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
885 aa  253  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 
874 aa  253  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 
880 aa  253  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1164  alanyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
885 aa  253  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.855181  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
885 aa  252  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1957  alanyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 
884 aa  252  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103878  normal  0.2106 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 
872 aa  251  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 
892 aa  252  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 
877 aa  251  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 
885 aa  252  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3523  alanyl-tRNA synthetase  28.59 
 
 
895 aa  251  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0021732 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 
876 aa  251  4e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2372  alanyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 
883 aa  251  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726035  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  26.02 
 
 
865 aa  251  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 
897 aa  250  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3034  alanyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 
888 aa  250  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672449  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 
890 aa  250  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
876 aa  249  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  26.21 
 
 
872 aa  249  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  26.03 
 
 
876 aa  249  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2579  alanyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 
913 aa  249  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159446  normal  0.328441 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 
867 aa  249  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 
882 aa  249  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  26 
 
 
876 aa  249  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 
902 aa  248  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 
884 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0156  alanyl-tRNA synthetase  27 
 
 
848 aa  248  4.9999999999999997e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 
876 aa  247  6e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  26 
 
 
876 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>