More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0657 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
892 aa  756    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 
892 aa  661    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
882 aa  760    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 
925 aa  854    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  49.95 
 
 
926 aa  825    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
926 aa  885    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
910 aa  797    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
924 aa  808    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  60.85 
 
 
923 aa  1142    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
896 aa  674    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 
913 aa  922    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
899 aa  664    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
892 aa  751    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 
916 aa  988    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
892 aa  750    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 
923 aa  1131    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 
915 aa  978    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
892 aa  756    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 
913 aa  979    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 
914 aa  993    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
913 aa  1860    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
907 aa  650    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
892 aa  654    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
926 aa  822    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
892 aa  654    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
900 aa  623  1e-177  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
904 aa  588  1e-166  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 
889 aa  514  1e-144  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 
880 aa  323  6e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 
876 aa  307  6e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 
877 aa  301  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
878 aa  300  8e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 
879 aa  298  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 
889 aa  295  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 
878 aa  293  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 
897 aa  291  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 
874 aa  289  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 
874 aa  290  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 
897 aa  289  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 
881 aa  287  5.999999999999999e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 
874 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 
875 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 
869 aa  284  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 
874 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 
879 aa  284  6.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 
883 aa  284  7.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 
897 aa  283  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 
874 aa  283  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
878 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 
874 aa  277  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 
865 aa  277  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 
878 aa  276  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 
864 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 
899 aa  276  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 
874 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 
874 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 
874 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 
874 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 
874 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 
872 aa  274  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 
874 aa  274  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 
888 aa  273  8.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 
886 aa  273  9e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 
859 aa  273  9e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  26.72 
 
 
884 aa  273  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 
863 aa  273  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 
878 aa  273  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 
902 aa  272  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 
884 aa  273  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 
879 aa  272  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 
879 aa  272  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 
886 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 
876 aa  271  4e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
874 aa  271  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 
874 aa  271  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 
874 aa  271  5.9999999999999995e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 
870 aa  270  7e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 
886 aa  270  1e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0047  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
871 aa  270  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.620417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
874 aa  269  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 
879 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 
880 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 
879 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 
863 aa  268  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 
874 aa  268  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 
879 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 
880 aa  267  7e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 
879 aa  266  8.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  27.47 
 
 
874 aa  266  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 
904 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 
874 aa  265  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0457  alanyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 
881 aa  265  3e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3034  alanyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 
888 aa  265  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672449  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 
863 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 
880 aa  264  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 
880 aa  264  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 
880 aa  263  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 
865 aa  263  8e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 
874 aa  263  8e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  26.72 
 
 
874 aa  263  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>