More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0912 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
876 aa  701    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
876 aa  700    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0050  alanyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
871 aa  733    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
875 aa  791    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
874 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
876 aa  751    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
867 aa  697    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0862  alanyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
877 aa  640    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.74806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
884 aa  714    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
880 aa  803    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
876 aa  678    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
872 aa  666    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
885 aa  690    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
874 aa  714    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
874 aa  713    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
880 aa  803    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
880 aa  801    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
880 aa  801    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
874 aa  707    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
860 aa  667    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
860 aa  668    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
899 aa  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1460  alanyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
890 aa  636    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.124208  hitchhiker  0.00581407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
871 aa  679    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
889 aa  674    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1377  alanyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
886 aa  643    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
874 aa  739    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
886 aa  706    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
891 aa  701    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
880 aa  663    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
874 aa  711    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  43.2 
 
 
873 aa  656    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
874 aa  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0451  alanyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
883 aa  673    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
882 aa  793    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
897 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
876 aa  803    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
880 aa  763    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
864 aa  742    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
880 aa  803    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
886 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 
899 aa  662    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 
862 aa  697    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2818  alanyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 
883 aa  649    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  51.47 
 
 
881 aa  853    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
874 aa  705    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
905 aa  750    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
881 aa  679    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
891 aa  706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1279  alanyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
881 aa  664    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302491  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1987  alanyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
884 aa  668    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
876 aa  688    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
875 aa  689    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
890 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
874 aa  699    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
878 aa  672    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
874 aa  722    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
874 aa  705    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
891 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 
868 aa  701    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
897 aa  704    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
890 aa  660    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
884 aa  731    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2201  alanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
885 aa  643    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
902 aa  682    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1720  alanyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
884 aa  663    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
897 aa  704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1359  alanyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
882 aa  656    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00180995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  42 
 
 
865 aa  714    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1266  alanyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
909 aa  688    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
877 aa  637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
879 aa  771    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
879 aa  771    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
874 aa  684    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
874 aa  672    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
874 aa  716    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
874 aa  716    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
869 aa  719    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
874 aa  709    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 
880 aa  757    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1008  alanyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
884 aa  636    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
874 aa  710    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
874 aa  731    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
872 aa  668    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1167  alanyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
885 aa  662    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
882 aa  727    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0556  alanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
893 aa  652    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
872 aa  649    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
880 aa  654    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
897 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
885 aa  777    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
878 aa  728    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
874 aa  712    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
886 aa  636    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
878 aa  796    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
888 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
885 aa  689    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
900 aa  697    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2628  alanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
874 aa  664    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
876 aa  694    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>