More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1513 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 882 aa  748    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 892 aa  655    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  67.87 
 
 		 913 aa  1355    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 915 aa  1880    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  69.33 
 
 		 914 aa  1358    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 925 aa  818    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 926 aa  796    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 899 aa  654    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 923 aa  971    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 910 aa  746    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 892 aa  708    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 926 aa  852    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 892 aa  722    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  62.26 
 
 		 913 aa  1187    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  62.45 
 
 		 916 aa  1231    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 896 aa  677    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 892 aa  668    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 923 aa  962    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 892 aa  712    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 924 aa  802    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 913 aa  993    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 926 aa  829    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 907 aa  659    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 892 aa  718    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 892 aa  661    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 900 aa  627  1e-178  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 904 aa  593  1e-168  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 889 aa  483  1e-135  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 		 870 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 875 aa  269  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 878 aa  268  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 877 aa  263  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  25.56 
 
 		 876 aa  262  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 		 889 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 		 856 aa  261  4e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 878 aa  261  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 		 863 aa  258  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 		 876 aa  258  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 863 aa  257  7e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  25.94 
 
 		 876 aa  256  9e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  25.53 
 
 		 883 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 869 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 		 876 aa  253  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 863 aa  252  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 880 aa  252  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 876 aa  252  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 		 886 aa  253  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 882 aa  251  6e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  26.19 
 
 		 876 aa  251  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  25.56 
 
 		 892 aa  250  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3034  alanyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 888 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672449  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 897 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 874 aa  248  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 874 aa  248  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 897 aa  248  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 874 aa  247  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 		 886 aa  247  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  26.81 
 
 		 879 aa  247  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  25.26 
 
 		 886 aa  247  6e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 		 878 aa  247  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 		 897 aa  247  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  24.49 
 
 		 865 aa  246  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 		 874 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  24.6 
 
 		 865 aa  246  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 		 859 aa  245  3e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 874 aa  245  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 		 884 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 879 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  24.9 
 
 		 931 aa  244  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 		 881 aa  244  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  25.11 
 
 		 865 aa  244  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  25.83 
 
 		 884 aa  243  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  25.7 
 
 		 876 aa  242  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 		 879 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  25.7 
 
 		 876 aa  242  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  25.7 
 
 		 876 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 		 876 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 		 876 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 		 876 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 		 876 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  25.11 
 
 		 875 aa  241  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 879 aa  241  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 874 aa  241  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 		 876 aa  241  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 880 aa  241  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 		 890 aa  241  5.999999999999999e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 875 aa  241  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 		 880 aa  241  6.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  25.59 
 
 		 876 aa  240  8e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 		 892 aa  240  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  24.65 
 
 		 860 aa  239  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 877 aa  239  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  27.77 
 
 		 864 aa  239  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 867 aa  239  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 877 aa  239  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 865 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 		 874 aa  238  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3763  alanyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 		 897 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469111  normal  0.276016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 		 880 aa  238  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 		 874 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>