More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1929 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  73.78 
 
 
925 aa  1347    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
892 aa  728    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
882 aa  738    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
910 aa  732    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  73.48 
 
 
926 aa  1325    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  73.84 
 
 
926 aa  1372    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
892 aa  736    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
923 aa  862    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
913 aa  849    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  75.03 
 
 
924 aa  1413    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
916 aa  860    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
926 aa  1868    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
892 aa  727    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
896 aa  643    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
923 aa  855    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
913 aa  806    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
915 aa  797    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
913 aa  836    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
892 aa  726    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
914 aa  811    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
892 aa  629  1e-179  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
892 aa  622  1e-177  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
900 aa  620  1e-176  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
904 aa  620  1e-176  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
892 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
899 aa  602  1e-170  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 
907 aa  596  1e-169  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
889 aa  522  1e-146  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 
878 aa  305  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 
877 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 
879 aa  298  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 
886 aa  293  1e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
880 aa  290  8e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 
886 aa  290  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 
886 aa  286  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 
889 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 
883 aa  281  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 
904 aa  281  5e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 
879 aa  281  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 
870 aa  280  6e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
876 aa  280  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 
878 aa  278  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 
882 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 
905 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 
864 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 
878 aa  275  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 
905 aa  275  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 
905 aa  275  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 
876 aa  274  5.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  29.48 
 
 
872 aa  272  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 
878 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 
869 aa  271  5e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 
897 aa  271  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 
897 aa  270  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 
876 aa  270  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 
865 aa  270  8e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 
865 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  28.78 
 
 
885 aa  270  8.999999999999999e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 
874 aa  270  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 
876 aa  270  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 
863 aa  269  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 
880 aa  269  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 
882 aa  266  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
897 aa  266  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0101  alanyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 
884 aa  266  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
860 aa  266  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 
874 aa  266  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  27.77 
 
 
865 aa  265  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0087  alanyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 
884 aa  265  4e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000138455  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 
879 aa  265  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 
865 aa  264  4.999999999999999e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 
859 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 
879 aa  264  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 
875 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 
872 aa  264  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 
874 aa  264  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 
875 aa  263  8.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  28.89 
 
 
906 aa  263  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 
874 aa  262  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 
874 aa  262  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 
874 aa  263  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 
878 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 
874 aa  262  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 
880 aa  262  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 
874 aa  261  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0223  alanyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 
894 aa  261  5.0000000000000005e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0181746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 
880 aa  260  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 
860 aa  260  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
868 aa  260  7e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  24.7 
 
 
856 aa  260  8e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 
874 aa  259  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07800  alanyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 
889 aa  259  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0367295 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 
874 aa  258  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  25.53 
 
 
877 aa  258  3e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 
874 aa  258  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  26.35 
 
 
892 aa  258  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  25.99 
 
 
875 aa  257  7e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 
879 aa  257  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 
886 aa  256  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 
863 aa  256  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>