More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1267 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 882 aa  750    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 900 aa  650    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  70.91 
 
 		 913 aa  1393    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 		 913 aa  1191    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 892 aa  738    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 892 aa  740    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 925 aa  841    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 892 aa  731    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  69.33 
 
 		 915 aa  1351    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 923 aa  985    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 926 aa  860    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 896 aa  655    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 892 aa  732    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 910 aa  767    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 914 aa  1887    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 916 aa  1299    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 899 aa  662    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 924 aa  803    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 		 923 aa  988    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 926 aa  799    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 892 aa  655    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 913 aa  997    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 907 aa  649    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 926 aa  822    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 892 aa  637    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 892 aa  620  1e-176  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 904 aa  612  9.999999999999999e-175  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 889 aa  509  9.999999999999999e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 889 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  24.84 
 
 		 878 aa  271  5e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 		 886 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 		 876 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 870 aa  268  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  26.54 
 
 		 865 aa  267  8e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  26.54 
 
 		 865 aa  267  8e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  26.24 
 
 		 877 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 886 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 		 878 aa  266  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 879 aa  265  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 886 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 		 869 aa  265  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 879 aa  265  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 		 875 aa  263  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 879 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 		 865 aa  261  5.0000000000000005e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 		 880 aa  260  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1614  alanyl-tRNA synthetase  26.41 
 
 		 869 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 878 aa  260  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 885 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 		 879 aa  258  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 879 aa  258  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 		 876 aa  258  5e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 		 883 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 876 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 		 876 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  25.21 
 
 		 892 aa  256  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 		 863 aa  255  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  25.3 
 
 		 865 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  25.96 
 
 		 876 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 876 aa  254  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 897 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 881 aa  253  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 		 872 aa  252  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 		 874 aa  253  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 		 878 aa  252  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 		 863 aa  251  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  26.72 
 
 		 880 aa  251  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 867 aa  251  4e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 		 874 aa  251  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  26.13 
 
 		 859 aa  251  5e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 874 aa  251  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 874 aa  250  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 		 874 aa  250  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 897 aa  250  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 		 874 aa  249  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  25.99 
 
 		 874 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  26.19 
 
 		 886 aa  248  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  25.94 
 
 		 880 aa  248  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 897 aa  248  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  26.07 
 
 		 874 aa  248  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 		 882 aa  248  4e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 874 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 		 874 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 		 874 aa  247  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 		 874 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  25.22 
 
 		 874 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  25.41 
 
 		 875 aa  246  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 931 aa  246  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 874 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  25.37 
 
 		 880 aa  245  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 892 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 876 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0898  alanyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 881 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  26.48 
 
 		 877 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  26.48 
 
 		 877 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 		 874 aa  244  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 		 880 aa  244  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  25.22 
 
 		 874 aa  244  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 882 aa  243  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  26.03 
 
 		 874 aa  243  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>